35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2847 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  863    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  37.38 
 
 
412 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  42.75 
 
 
618 aa  87.8  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  38.51 
 
 
217 aa  84  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  40.65 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  32.18 
 
 
678 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  33.97 
 
 
631 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  37.12 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  37.84 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  30.73 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  32.16 
 
 
739 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  35.44 
 
 
374 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  35.4 
 
 
1700 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  26.09 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  26.09 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  26.09 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  26.09 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  26.09 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  30.71 
 
 
648 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  28.3 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  28.3 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  27.73 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  32.65 
 
 
892 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  25.36 
 
 
189 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  25.36 
 
 
189 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  29.25 
 
 
191 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  30.43 
 
 
180 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  28.3 
 
 
189 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  33.04 
 
 
207 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  38.38 
 
 
385 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  25.4 
 
 
166 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  35.14 
 
 
222 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  25.93 
 
 
166 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  29.13 
 
 
166 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  29.08 
 
 
217 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>