74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2579 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  100 
 
 
166 aa  327  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  96.39 
 
 
166 aa  316  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  39.19 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  39.86 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  37.74 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  40.38 
 
 
217 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  30.3 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  33.57 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  35.14 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  33.14 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  33.14 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  37.78 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  37.78 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  33.71 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  37.78 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  37.78 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  37.78 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  33.12 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  33.12 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  34.65 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  36.09 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36729  Signal sequence processing protein  32.62 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.501968  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  33.67 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  26.62 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  38 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  38.38 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10354  Signal peptidase I (AFU_orthologue; AFUA_3G12840)  32.93 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0778272  normal  0.862016 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  33.02 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0503  peptidase S26B, signal peptidase  25.75 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  39.53 
 
 
387 aa  61.6  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  32.08 
 
 
216 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00480  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 
221 aa  61.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  36.56 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  32.77 
 
 
232 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  35.42 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  29.06 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2240  peptidase S26B, signal peptidase  36.25 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  30.83 
 
 
177 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  33.64 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  29.03 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  46.38 
 
 
381 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  31.31 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  39.19 
 
 
618 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1909  hypothetical protein  35.14 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  39.44 
 
 
391 aa  55.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  35.11 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1239  peptidase S24, S26A and S26B  26.02 
 
 
203 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1326  peptidase S26B, signal peptidase  38.81 
 
 
338 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51280  predicted protein  28.67 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  36.11 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0869  peptidase S26B, signal peptidase  27.64 
 
 
226 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1734  peptidase S26B, signal peptidase  27.41 
 
 
184 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0663  peptidase S26B, signal peptidase  29.13 
 
 
178 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  36.14 
 
 
309 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  38.36 
 
 
397 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1004  signal sequence peptidase  30.15 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  29.17 
 
 
217 aa  50.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  34.72 
 
 
385 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1306  signal peptidase I  27.61 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.822396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5563  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  29.63 
 
 
300 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425779  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2030  peptidase S26B, signal peptidase  32.5 
 
 
488 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000643022  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87247  predicted protein  29.36 
 
 
203 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0943769  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  26.17 
 
 
448 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0863  putative phage repressor  34.52 
 
 
281 aa  44.3  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0523  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  23.2 
 
 
191 aa  44.3  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0292  putative phage repressor  32.61 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0000355656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1251  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  23.2 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2411  peptidase S26B, signal peptidase  26.57 
 
 
235 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1685  peptidase S26B, signal peptidase  31.25 
 
 
638 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1385  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  22.1 
 
 
213 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.448996  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2827  hypothetical protein  31.76 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4175  peptidase S26B, signal peptidase  38.24 
 
 
372 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  34.78 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>