48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0128 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 
353 aa  675    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  48.47 
 
 
179 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  31.69 
 
 
191 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  33.72 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  33.72 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  37.5 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  36.67 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  32.75 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  37.5 
 
 
189 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  35.48 
 
 
174 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  39.39 
 
 
166 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  39.19 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  38 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  36.09 
 
 
217 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  40.18 
 
 
222 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  37 
 
 
166 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  43.12 
 
 
207 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  42.73 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  30.63 
 
 
217 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  36.19 
 
 
222 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  31.93 
 
 
618 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36729  Signal sequence processing protein  29.51 
 
 
166 aa  56.2  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.501968  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  33.06 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  35.26 
 
 
218 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  36.75 
 
 
420 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  32.2 
 
 
191 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  34.23 
 
 
216 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  32.43 
 
 
236 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  31.71 
 
 
180 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1306  signal peptidase I  30.23 
 
 
167 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.822396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0869  peptidase S26B, signal peptidase  39.6 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  35.78 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10354  Signal peptidase I (AFU_orthologue; AFUA_3G12840)  25.42 
 
 
192 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0778272  normal  0.862016 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  34.38 
 
 
197 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  31.93 
 
 
232 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2827  hypothetical protein  28.29 
 
 
203 aa  46.2  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0663  peptidase S26B, signal peptidase  32 
 
 
178 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00480  conserved hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  33.65 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  29.34 
 
 
185 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1374  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  29.27 
 
 
184 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359092  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  34.68 
 
 
183 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51280  predicted protein  26.36 
 
 
185 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>