42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2961 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  36 
 
 
185 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  37.78 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  31.71 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  31.55 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  32.32 
 
 
166 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  39.6 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  39.84 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  33.93 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  33.93 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  31.22 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  31.22 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  31.22 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  31.22 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  31.22 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  33.13 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  40.98 
 
 
222 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0869  peptidase S26B, signal peptidase  36.5 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  31.93 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  29.1 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  34.13 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  28.25 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  31.33 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  33.03 
 
 
174 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  32.06 
 
 
166 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  32.26 
 
 
180 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  33.95 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  34.38 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  35.66 
 
 
618 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  32.09 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  35.51 
 
 
368 aa  55.8  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  30.88 
 
 
420 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  28.18 
 
 
185 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  30.19 
 
 
197 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  31.65 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  32.68 
 
 
183 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51280  predicted protein  28.22 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2240  peptidase S26B, signal peptidase  31.87 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  29.13 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  30.48 
 
 
179 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1239  peptidase S24, S26A and S26B  32.48 
 
 
203 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0663  peptidase S26B, signal peptidase  27.57 
 
 
178 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>