42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0890 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 
222 aa  421  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  48.63 
 
 
217 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  39.86 
 
 
618 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  39.72 
 
 
448 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  37.3 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  29.69 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  28.91 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  41.23 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  37.1 
 
 
420 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  37.09 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  33.59 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  29.59 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  32.58 
 
 
189 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  28.57 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  32.85 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  31.06 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  35.59 
 
 
179 aa  58.5  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  31.06 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  31.06 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  31.06 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  31.06 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  31.06 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  30.3 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  30.3 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  30.66 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  33.59 
 
 
353 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  30.66 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  35.78 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  30.05 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  29.53 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  34.57 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  27.06 
 
 
188 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  30.53 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  32.65 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  29.27 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  35.88 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  38.75 
 
 
397 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2030  peptidase S26B, signal peptidase  36.63 
 
 
488 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000643022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1239  peptidase S24, S26A and S26B  36.36 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0503  peptidase S26B, signal peptidase  30.16 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19741  putative signal peptidase  39.33 
 
 
91 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0299302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  27.87 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>