49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0493 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  100 
 
 		 174 aa  339  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  95.78 
 
 		 166 aa  313  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  39.74 
 
 		 166 aa  94.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  39.86 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  33.61 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  39.8 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  35.48 
 
 		 353 aa  78.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  33.8 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  34.92 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  30.94 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  40.95 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  30.28 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  30.28 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  30.28 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  30.28 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  30.28 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  30.99 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  30.99 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  34.11 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  34.11 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  36.17 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  33.03 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2844  peptidase S26B, signal peptidase  33.06 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  28.89 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2922  peptidase S26B, signal peptidase  34.21 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  29.59 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0663  peptidase S26B, signal peptidase  26.35 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  33.68 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  30.84 
 
 		 420 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3518  peptidase S26B, signal peptidase  31.15 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00808654  normal  0.222242 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0503  peptidase S26B, signal peptidase  27.63 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  23.73 
 
 		 217 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0869  peptidase S26B, signal peptidase  31.25 
 
 		 226 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  30.84 
 
 		 309 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1385  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  26.63 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.448996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1251  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  25 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  26.92 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  31.25 
 
 		 236 aa  47.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  23.02 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  39.29 
 
 		 618 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0523  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  24.44 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  29.23 
 
 		 351 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  27.21 
 
 		 385 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  22.84 
 
 		 387 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1374  microsomal signal peptidase 21 KD subunit  35.44 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  31.09 
 
 		 381 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  29.13 
 
 		 448 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  24.03 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3849  hypothetical protein  31.96 
 
 		 244 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>