More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3849 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3849  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1525  signal peptidase I  32.44 
 
 
258 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1516  signal peptidase I  32.44 
 
 
274 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  38.32 
 
 
288 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.68 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  32.82 
 
 
325 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.24 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  32.21 
 
 
321 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  38.89 
 
 
284 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  35.03 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  40.82 
 
 
321 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  35.03 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  32.62 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  34.46 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  27.71 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  37.01 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  37.01 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  37.5 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  37.5 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  34.04 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  33.71 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  35.65 
 
 
325 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  32.26 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  32.96 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  37.28 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  34.04 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  36.17 
 
 
342 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  33.89 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  33.18 
 
 
297 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  36.22 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  32.7 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  38.69 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  38.69 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.43 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  36.47 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  35.79 
 
 
299 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  32.42 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.98 
 
 
305 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  34.55 
 
 
322 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  37.04 
 
 
298 aa  88.6  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  36.69 
 
 
284 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  40.25 
 
 
263 aa  88.2  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  35.12 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  35.59 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.73 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  36.36 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  30.86 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  35.5 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  31.96 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  30.49 
 
 
381 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  34.32 
 
 
268 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.17 
 
 
257 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  34.1 
 
 
268 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  35.42 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  32.86 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  32.86 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  32.97 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  36.75 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  36.31 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  31.94 
 
 
324 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  32.86 
 
 
305 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  34.34 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  32.04 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.76 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  33.63 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  37.5 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  35.88 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  36.31 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  37.66 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  36.31 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  35.59 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  33.53 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  36.31 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  33.53 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  35.59 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32.86 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  34.07 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  34.13 
 
 
322 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  35.59 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  36.67 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  35.59 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  27.73 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  35.06 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  31.44 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  36.72 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  32.39 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  33.52 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.03 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>