20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2822 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 
351 aa  699    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  25.82 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4175  peptidase S26B, signal peptidase  27.02 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1261  peptidase S26B, signal peptidase  26.92 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.634938  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  25.52 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  35.34 
 
 
194 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1326  peptidase S26B, signal peptidase  43.04 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  37.61 
 
 
368 aa  59.3  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  34.23 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  38.14 
 
 
420 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  27.27 
 
 
166 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  23.53 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  24.54 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.287318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1897  peptidase S26B, signal peptidase  36.27 
 
 
141 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.660816  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  29.91 
 
 
222 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  34.13 
 
 
179 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  26.58 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  30 
 
 
177 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  27.39 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  31.94 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>