22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0480 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 		 387 aa  761    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1326  peptidase S26B, signal peptidase  50 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  43.45 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4175  peptidase S26B, signal peptidase  45.82 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  42 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  40.16 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  40.7 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  48.87 
 
 		 194 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1261  peptidase S26B, signal peptidase  23.4 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.634938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  39.53 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  37.65 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  35.71 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  35.11 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  30.18 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 		 351 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  34.95 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  31.25 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  35.71 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17050  signal peptidase I  33.12 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0856146  normal  0.95048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  22.84 
 
 		 174 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0863  putative phage repressor  31.3 
 
 		 281 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>