38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0863 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0863  putative phage repressor  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0292  putative phage repressor  100 
 
 
129 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0000355656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  33.08 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  37.04 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  34.29 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  36.57 
 
 
183 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  38.04 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0503  peptidase S26B, signal peptidase  37.1 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  34.31 
 
 
197 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  37.14 
 
 
197 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  35.07 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  36.11 
 
 
385 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  36.28 
 
 
381 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  36.9 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  36.9 
 
 
166 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  40.66 
 
 
179 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1326  peptidase S26B, signal peptidase  38.75 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
387 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  40.79 
 
 
391 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  39.47 
 
 
397 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  34.83 
 
 
618 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  38.04 
 
 
191 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  33.62 
 
 
448 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  37.37 
 
 
222 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00480  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2030  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
488 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000643022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  32.22 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  31.37 
 
 
166 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4175  peptidase S26B, signal peptidase  41.03 
 
 
372 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1909  hypothetical protein  36.99 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1685  peptidase S26B, signal peptidase  33.91 
 
 
638 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  36.47 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  33.7 
 
 
353 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  30.21 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1004  signal sequence peptidase  24.68 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  29.41 
 
 
174 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1897  peptidase S26B, signal peptidase  28.21 
 
 
141 aa  42.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.660816  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36729  Signal sequence processing protein  31.25 
 
 
166 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.501968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>