74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4390 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 		 420 aa  822    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  46.15 
 
 		 618 aa  97.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  51.26 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  30.77 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  29.49 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  29.01 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  29.01 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  29.01 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  29.01 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  29.01 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  34.71 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  28.4 
 
 		 189 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  28.4 
 
 		 189 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  29.49 
 
 		 189 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  30.13 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0959  peptidase S26B, signal peptidase  36.71 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.338093  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  33.06 
 
 		 166 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  37.12 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3635  peptidase S26B, signal peptidase  38.17 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0890  peptidase S26B, signal peptidase  39.45 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1312  peptidase S26B, signal peptidase  38.14 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1261  peptidase S26B, signal peptidase  27.19 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.634938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.94 
 
 		 1298 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0493  signal peptidase I  30.17 
 
 		 174 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.87 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0480  peptidase, putative  31.03 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  36.49 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4237  peptidase S26B, signal peptidase  37.59 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2961  signal peptidase SipW  33.33 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0863  putative phage repressor  33.08 
 
 		 281 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  32.28 
 
 		 216 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10354  Signal peptidase I (AFU_orthologue; AFUA_3G12840)  33.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0778272  normal  0.862016 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51280  predicted protein  31.65 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  33.06 
 
 		 2066 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  42.86 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.38 
 
 		 1565 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36729  Signal sequence processing protein  34.26 
 
 		 166 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.501968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0128  peptidase S26B, signal peptidase  36.75 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2637  peptidase S26B, signal peptidase  41 
 
 		 207 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  25 
 
 		 1367 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  34.56 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.34 
 
 		 1424 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25 
 
 		 2447 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  36.63 
 
 		 197 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  34.04 
 
 		 180 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  34.94 
 
 		 4433 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  40.4 
 
 		 194 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  36.28 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  37.4 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1326  peptidase S26B, signal peptidase  40.7 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  38.71 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2832  peptidase S26B, signal peptidase  37.96 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.79 
 
 		 1064 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0292  putative phage repressor  35.42 
 
 		 129 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0000355656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.33 
 
 		 1292 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00480  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 221 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1916 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  26.5 
 
 		 2334 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2206  peptidase S26B, signal peptidase  36.94 
 
 		 309 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  34.95 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 1577 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  43.75 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  27.66 
 
 		 1150 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.27 
 
 		 1310 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1101 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  40 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.25 
 
 		 4761 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  29.63 
 
 		 1009 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  28.93 
 
 		 4357 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1931 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4175  peptidase S26B, signal peptidase  41.96 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2030  peptidase S26B, signal peptidase  32.43 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000643022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  29.33 
 
 		 545 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  30.82 
 
 		 183 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>