111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2915 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  100 
 
 		 1310 aa  2610    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  42.05 
 
 		 1035 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  35.66 
 
 		 514 aa  129  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  69.41 
 
 		 2042 aa  104  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  64.37 
 
 		 757 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  66.28 
 
 		 1673 aa  90.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  64.71 
 
 		 1394 aa  87.4  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  39.58 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.9 
 
 		 4761 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  48.72 
 
 		 1848 aa  84  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  72.62 
 
 		 1672 aa  81.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  39.1 
 
 		 409 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  29.02 
 
 		 471 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  51.72 
 
 		 859 aa  74.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  72.4  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  43.68 
 
 		 1879 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.08 
 
 		 1323 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0745  hypothetical protein  37.04 
 
 		 146 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  27.96 
 
 		 1306 aa  69.3  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  30.43 
 
 		 6678 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  52.75 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  38.94 
 
 		 2002 aa  66.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  28.73 
 
 		 786 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  39.56 
 
 		 1672 aa  64.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1367 aa  64.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  29.35 
 
 		 3907 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  26.16 
 
 		 2066 aa  61.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  43.69 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  52.7 
 
 		 336 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  37.28 
 
 		 1695 aa  59.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1504 aa  58.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  28.1 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.57 
 
 		 288 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1432  hypothetical protein  31.4 
 
 		 172 aa  57.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000213962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  38.18 
 
 		 1303 aa  56.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.82 
 
 		 846 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3228  hypothetical protein  26.47 
 
 		 447 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.159328  normal  0.346325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 		 1064 aa  55.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.96 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  31.9 
 
 		 1735 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.07 
 
 		 616 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.24 
 
 		 1876 aa  53.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.47 
 
 		 746 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.42 
 
 		 236 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.18 
 
 		 598 aa  53.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  43.84 
 
 		 1095 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  23.98 
 
 		 249 aa  52.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.46 
 
 		 4357 aa  52.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  27.19 
 
 		 316 aa  52  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.5 
 
 		 1967 aa  51.6  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  32.61 
 
 		 299 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  25.53 
 
 		 181 aa  51.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  27.7 
 
 		 1577 aa  51.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  33.33 
 
 		 343 aa  51.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  25.64 
 
 		 2223 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  31.33 
 
 		 772 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  27.42 
 
 		 1150 aa  50.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  26.64 
 
 		 1067 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  53.62 
 
 		 247 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.48 
 
 		 1001 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 804 aa  50.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  24.48 
 
 		 376 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1193 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  25.13 
 
 		 1121 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  36.67 
 
 		 1736 aa  49.7  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3234  hypothetical protein  23.76 
 
 		 283 aa  49.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  25.74 
 
 		 999 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.07 
 
 		 590 aa  49.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  28.24 
 
 		 313 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  32.85 
 
 		 333 aa  49.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  25.11 
 
 		 747 aa  49.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.28 
 
 		 1212 aa  49.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 1121 aa  48.9  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.89 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.84 
 
 		 726 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  48.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2082 aa  48.5  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  23.78 
 
 		 1174 aa  48.5  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  29.08 
 
 		 981 aa  48.5  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1931 aa  48.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  31.43 
 
 		 176 aa  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.83 
 
 		 1679 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.48 
 
 		 598 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  25.22 
 
 		 424 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3438  hypothetical protein  34.88 
 
 		 253 aa  47.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.173731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  23.68 
 
 		 250 aa  47.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  32.22 
 
 		 1428 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.98 
 
 		 12684 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3209  hypothetical protein  34.88 
 
 		 253 aa  47.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.48 
 
 		 1073 aa  47.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  32.32 
 
 		 897 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  31.33 
 
 		 1729 aa  47.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  26.36 
 
 		 252 aa  47.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1699 aa  46.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  23.21 
 
 		 258 aa  46.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  25.22 
 
 		 251 aa  47  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.57 
 
 		 1109 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  22.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>