39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5363 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 
265 aa  524  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32.91 
 
 
1298 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.41 
 
 
4761 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  27.31 
 
 
420 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4501  hypothetical protein  33.55 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538252  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  33.61 
 
 
1265 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.68 
 
 
1035 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
603 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  25.21 
 
 
1367 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.58 
 
 
1072 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.91 
 
 
4433 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.63 
 
 
2066 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  31.76 
 
 
466 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  30.57 
 
 
3861 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  27.24 
 
 
1565 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  34 
 
 
1916 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  31.08 
 
 
468 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.3 
 
 
3822 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  31.03 
 
 
4357 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  27.5 
 
 
2447 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  30.15 
 
 
981 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 
1143 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  27.39 
 
 
1310 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  28.44 
 
 
643 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  27.98 
 
 
531 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.32 
 
 
598 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25.41 
 
 
6678 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  30.3 
 
 
1159 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  30.08 
 
 
793 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.01 
 
 
1424 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
585 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 
1067 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  26.69 
 
 
1150 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  29.52 
 
 
1504 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  26.11 
 
 
471 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  22.22 
 
 
1121 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
1121 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
1121 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25.97 
 
 
1413 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>