58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3263 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  100 
 
 		 1072 aa  2162    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  34.38 
 
 		 1306 aa  333  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1576 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  36.83 
 
 		 1258 aa  231  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  37.75 
 
 		 1255 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  31.4 
 
 		 1257 aa  231  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  37.08 
 
 		 1248 aa  230  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1252 aa  230  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1543 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  29.88 
 
 		 1553 aa  227  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  37.44 
 
 		 1261 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1463 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1543 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1543 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1541 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  29.99 
 
 		 837 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1532 aa  211  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  25.24 
 
 		 1537 aa  204  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  27.14 
 
 		 1382 aa  180  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  26.63 
 
 		 906 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  27.14 
 
 		 900 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1085 aa  170  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  32.68 
 
 		 907 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1133 aa  146  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1504 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  26.23 
 
 		 1168 aa  108  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1508 aa  95.5  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  25.09 
 
 		 1008 aa  91.3  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.95 
 
 		 4761 aa  89  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  25.9 
 
 		 793 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1202 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  34.88 
 
 		 739 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  33.95 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1367 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  33.49 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.37 
 
 		 1265 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  29.23 
 
 		 2447 aa  58.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1191 aa  57.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  30.83 
 
 		 757 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  25.6 
 
 		 307 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25.24 
 
 		 236 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  26.58 
 
 		 265 aa  55.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.91 
 
 		 4357 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  25.53 
 
 		 3907 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  27.68 
 
 		 313 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.1 
 
 		 754 aa  53.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1931 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.67 
 
 		 1035 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.3 
 
 		 273 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1544 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.66 
 
 		 1735 aa  49.3  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.13 
 
 		 846 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.89 
 
 		 1310 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.47 
 
 		 11716 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  26.56 
 
 		 736 aa  48.5  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.22 
 
 		 2334 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1101 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  23.24 
 
 		 1013 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>