31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0182 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  100 
 
 		 1537 aa  3131    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.24 
 
 		 1072 aa  206  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  24.87 
 
 		 1306 aa  188  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  27.04 
 
 		 900 aa  172  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1133 aa  167  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  26.54 
 
 		 906 aa  161  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  25.84 
 
 		 1258 aa  153  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  25.45 
 
 		 1248 aa  149  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  26.95 
 
 		 1382 aa  149  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1504 aa  145  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  25.82 
 
 		 1255 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1252 aa  139  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  24.5 
 
 		 1261 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  24.19 
 
 		 1257 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  25 
 
 		 1085 aa  125  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1463 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1576 aa  122  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  25.23 
 
 		 1168 aa  117  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  24.74 
 
 		 837 aa  116  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1532 aa  95.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1553 aa  92.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1543 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1543 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1541 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1543 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1508 aa  65.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  24.64 
 
 		 907 aa  60.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  32.43 
 
 		 2364 aa  55.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  24.68 
 
 		 3094 aa  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  23.9 
 
 		 793 aa  48.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1202 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>