150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4996 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 846 aa  1718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  61.85 
 
 		 614 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  51.61 
 
 		 771 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  39.58 
 
 		 641 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  37.46 
 
 		 1025 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  33.46 
 
 		 955 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  36.5 
 
 		 760 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  34.92 
 
 		 795 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  34.36 
 
 		 792 aa  350  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  34.1 
 
 		 795 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  34.1 
 
 		 795 aa  343  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  33.49 
 
 		 803 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  36.62 
 
 		 783 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  36.14 
 
 		 844 aa  333  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  33.83 
 
 		 765 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  32.45 
 
 		 744 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  29.78 
 
 		 597 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  34.17 
 
 		 881 aa  250  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  30.46 
 
 		 752 aa  230  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  32.71 
 
 		 749 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  51.76 
 
 		 739 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  51.26 
 
 		 739 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  52.24 
 
 		 767 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  29.6 
 
 		 607 aa  170  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  45.79 
 
 		 757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  35.71 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  46.84 
 
 		 718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  42.2 
 
 		 1013 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  25.49 
 
 		 596 aa  134  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  25.34 
 
 		 602 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  37.44 
 
 		 1323 aa  111  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  25.44 
 
 		 711 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  37.04 
 
 		 739 aa  104  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  24.63 
 
 		 638 aa  88.6  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  23.39 
 
 		 652 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  23.13 
 
 		 684 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  25.84 
 
 		 647 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  30.73 
 
 		 741 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  30.17 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  30.17 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  26.5 
 
 		 648 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  23.69 
 
 		 672 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  22.11 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  25.34 
 
 		 634 aa  73.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.73 
 
 		 864 aa  74.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  24.48 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  24.14 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  22.92 
 
 		 651 aa  72  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  22.76 
 
 		 651 aa  71.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  24.43 
 
 		 617 aa  70.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  23 
 
 		 680 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  26.12 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  22.92 
 
 		 651 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  23.2 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  22.71 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  22.71 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  29.63 
 
 		 804 aa  67.8  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1576 aa  67.8  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  24 
 
 		 640 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  22.71 
 
 		 673 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.23 
 
 		 1147 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.22 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  24.86 
 
 		 640 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  34.86 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.48 
 
 		 4357 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  36.2 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  27.48 
 
 		 679 aa  65.1  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  31.96 
 
 		 6678 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.64 
 
 		 236 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.51 
 
 		 848 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  22.22 
 
 		 655 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0641  hypothetical protein  29.15 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  35.71 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  22.34 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1101 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  24 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  23.13 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  22.95 
 
 		 628 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  23.72 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  30.67 
 
 		 250 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  22.22 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  22.22 
 
 		 659 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  22.02 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  23.33 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  22.22 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.6 
 
 		 4433 aa  58.9  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  33.33 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0666  hypothetical protein  28.32 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1931 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.49 
 
 		 1064 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.31 
 
 		 4761 aa  57.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  34.15 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  23.5 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 11716 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  28.96 
 
 		 250 aa  57.4  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  23.08 
 
 		 800 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  22.45 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1164 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  28.82 
 
 		 1310 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>