68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0759 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 907 aa  1808    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  33.47 
 
 		 1306 aa  204  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  32.68 
 
 		 1072 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1202 aa  127  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1504 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1191 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1252 aa  91.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1133 aa  90.5  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  34.5 
 
 		 2487 aa  88.2  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1576 aa  87.8  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  27.58 
 
 		 900 aa  87  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.86 
 
 		 3191 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  37.14 
 
 		 3602 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  25.51 
 
 		 1168 aa  85.1  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  44.59 
 
 		 983 aa  84.7  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  26.75 
 
 		 1382 aa  79  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40.98 
 
 		 3324 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  40.8 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1532 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  40.27 
 
 		 1293 aa  71.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  37.76 
 
 		 3921 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  22.47 
 
 		 906 aa  67  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  34.15 
 
 		 2005 aa  66.6  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1553 aa  67  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1463 aa  65.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.64 
 
 		 1989 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1504 aa  64.7  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 2573 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  25.3 
 
 		 1537 aa  63.9  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  41.22 
 
 		 4896 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.54 
 
 		 3737 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1543 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  35.14 
 
 		 826 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  21 
 
 		 1508 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  36.51 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1543 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1543 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  29.51 
 
 		 587 aa  55.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  24.6 
 
 		 1257 aa  54.7  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1541 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  37.04 
 
 		 612 aa  52.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  37.7 
 
 		 853 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  22.03 
 
 		 793 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1537 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4227  hypothetical protein  45.24 
 
 		 154 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.298131  normal  0.491791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  38.46 
 
 		 827 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  34.21 
 
 		 644 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  32.11 
 
 		 444 aa  49.7  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  28.7 
 
 		 621 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1059 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30.92 
 
 		 3634 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  35.04 
 
 		 3471 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  28.1 
 
 		 315 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  36.55 
 
 		 900 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  27.36 
 
 		 1168 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  31 
 
 		 1150 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1038 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  24.26 
 
 		 1255 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1227 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  36.59 
 
 		 2713 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 951 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.47 
 
 		 2000 aa  45.8  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  24.01 
 
 		 1261 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 		 743 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  32.47 
 
 		 545 aa  44.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  25.06 
 
 		 837 aa  44.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  24.02 
 
 		 1248 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  30.71 
 
 		 1483 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>