57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0886 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  34.97 
 
 		 801 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1072  hypothetical protein  30.12 
 
 		 725 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0404  hypothetical protein  32.69 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321562  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4610  hypothetical protein  27.09 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  30.45 
 
 		 675 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  48.33 
 
 		 1989 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  49.41 
 
 		 2573 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 3921 aa  61.6  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  41.67 
 
 		 826 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  50 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  45.12 
 
 		 1293 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  44.68 
 
 		 983 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  44.05 
 
 		 3191 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  43.33 
 
 		 1118 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  42.53 
 
 		 1150 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  36.05 
 
 		 1750 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  31.72 
 
 		 807 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  28.78 
 
 		 495 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  43.9 
 
 		 2713 aa  53.5  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  39.08 
 
 		 1168 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1202 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1038 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  38.27 
 
 		 726 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  43.94 
 
 		 444 aa  52  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  41.3 
 
 		 3602 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  39.13 
 
 		 587 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  38.95 
 
 		 1227 aa  51.2  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  37.11 
 
 		 907 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  43.21 
 
 		 3324 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  48.21 
 
 		 792 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  40.59 
 
 		 440 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  34.69 
 
 		 5017 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2837  hypothetical protein  27.68 
 
 		 320 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  27.81 
 
 		 315 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  31.75 
 
 		 2118 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  41.03 
 
 		 2912 aa  47  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  27.35 
 
 		 845 aa  45.8  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1954  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.33 
 
 		 570 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  45.56 
 
 		 4896 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  38.46 
 
 		 644 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4109  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.28 
 
 		 775 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.593331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  33.98 
 
 		 5010 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00791  Rhs family protein  28.19 
 
 		 471 aa  46.2  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0158611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  41.98 
 
 		 2520 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  29.52 
 
 		 5010 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  31.53 
 
 		 5010 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  32.08 
 
 		 2886 aa  45.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  31.53 
 
 		 5017 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  31.53 
 
 		 5017 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  32.95 
 
 		 301 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 693 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  32.11 
 
 		 853 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  40.48 
 
 		 2121 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.6 
 
 		 2490 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  35.87 
 
 		 743 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  43.62 
 
 		 3911 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>