53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0327 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 743 aa  1486    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  42.91 
 
 		 792 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.3 
 
 		 852 aa  217  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  44.41 
 
 		 853 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  43.66 
 
 		 990 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  34.19 
 
 		 799 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  34.88 
 
 		 775 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  43.14 
 
 		 1092 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  38.46 
 
 		 1750 aa  170  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  31.3 
 
 		 1332 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.66 
 
 		 2192 aa  159  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  32.85 
 
 		 1216 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  32.25 
 
 		 1170 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.49 
 
 		 507 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 		 831 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.35 
 
 		 1296 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1010 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  33.46 
 
 		 417 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  28.83 
 
 		 3602 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1055 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.1 
 
 		 1755 aa  89.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  26.62 
 
 		 441 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.27 
 
 		 1526 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1318 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  27.79 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1263 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.58 
 
 		 2031 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29 
 
 		 3191 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.94 
 
 		 5453 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  40.6 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1106 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  27.36 
 
 		 2520 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1750 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1537 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.34 
 
 		 1989 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  26.29 
 
 		 3634 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  25.37 
 
 		 2113 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.37 
 
 		 2520 aa  47.4  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  25.41 
 
 		 617 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 		 2573 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  25.37 
 
 		 1533 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.92 
 
 		 2490 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  29.45 
 
 		 3324 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  23.71 
 
 		 591 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  38.1 
 
 		 526 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.31 
 
 		 5010 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  24.88 
 
 		 1857 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.37 
 
 		 2121 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  27.62 
 
 		 907 aa  44.3  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  38.04 
 
 		 983 aa  44.3  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  26.73 
 
 		 2490 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1076 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 1293 aa  44.3  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>