226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3586 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 3324 aa  6635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  32.19 
 
 		 2270 aa  253  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  42.42 
 
 		 711 aa  192  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  40.89 
 
 		 5745 aa  176  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.82 
 
 		 3793 aa  175  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  41.25 
 
 		 2990 aa  152  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  40.68 
 
 		 5517 aa  150  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  40.57 
 
 		 1337 aa  148  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  40.57 
 
 		 1337 aa  148  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  40.93 
 
 		 1263 aa  142  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  41.35 
 
 		 5544 aa  139  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  42.45 
 
 		 965 aa  137  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  42.45 
 
 		 965 aa  137  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  39.08 
 
 		 2604 aa  130  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  37.55 
 
 		 1153 aa  125  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  37.55 
 
 		 1153 aa  125  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  38.17 
 
 		 733 aa  121  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  35.17 
 
 		 5166 aa  119  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  35.82 
 
 		 5203 aa  114  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  35.63 
 
 		 892 aa  108  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  44.5 
 
 		 1727 aa  106  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  29.63 
 
 		 1377 aa  105  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  35.52 
 
 		 2876 aa  103  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  33.72 
 
 		 2890 aa  100  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  30.37 
 
 		 1519 aa  83.2  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  25.31 
 
 		 2278 aa  82.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1287 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1547 aa  81.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  31.69 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  42.45 
 
 		 3602 aa  79.7  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  33.47 
 
 		 2112 aa  79.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  34.68 
 
 		 3373 aa  77.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35 
 
 		 2005 aa  77.4  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  40.77 
 
 		 2047 aa  76.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  40.98 
 
 		 907 aa  76.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  30.84 
 
 		 989 aa  76.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  40.22 
 
 		 871 aa  76.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  42.53 
 
 		 3737 aa  75.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  38.39 
 
 		 1483 aa  74.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  24.21 
 
 		 4429 aa  74.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.63 
 
 		 4896 aa  73.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  34.57 
 
 		 644 aa  73.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30.05 
 
 		 2656 aa  73.2  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.41 
 
 		 3191 aa  72.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  36.08 
 
 		 2588 aa  72.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4301  Fibronectin type III domain protein  27.22 
 
 		 1799 aa  72.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130951  decreased coverage  0.00087761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.92 
 
 		 1068 aa  71.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1064 aa  71.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  28.67 
 
 		 1748 aa  70.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  32.48 
 
 		 991 aa  68.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  41.25 
 
 		 890 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  39.02 
 
 		 636 aa  68.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  26.96 
 
 		 2434 aa  68.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  42.2 
 
 		 3921 aa  68.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  43.59 
 
 		 3927 aa  68.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1059 aa  68.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1980 aa  68.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1665 aa  67.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  31.82 
 
 		 3542 aa  67.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.84 
 
 		 1288 aa  67.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  36.47 
 
 		 1371 aa  67.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  38.27 
 
 		 750 aa  67.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  37.04 
 
 		 885 aa  67  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  32.32 
 
 		 5017 aa  66.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  32.16 
 
 		 5017 aa  66.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  41.49 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  29.95 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  32.14 
 
 		 315 aa  66.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  32.39 
 
 		 1243 aa  65.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  39.51 
 
 		 599 aa  65.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.47 
 
 		 1293 aa  65.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  32.16 
 
 		 5017 aa  65.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  36.17 
 
 		 799 aa  65.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2072  hypothetical protein  33.82 
 
 		 413 aa  65.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  38.82 
 
 		 1389 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  36.36 
 
 		 4071 aa  65.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 5010 aa  64.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  31.52 
 
 		 1160 aa  64.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  34.41 
 
 		 503 aa  64.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  36.2 
 
 		 621 aa  64.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40 
 
 		 2377 aa  63.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  36.78 
 
 		 627 aa  63.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  37.59 
 
 		 3682 aa  63.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  37.5 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  42.86 
 
 		 676 aa  62.4  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 		 581 aa  62.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  37.78 
 
 		 3227 aa  62.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  35.23 
 
 		 640 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.56 
 
 		 3471 aa  62.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  46 
 
 		 1230 aa  62.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  31.68 
 
 		 5017 aa  61.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  31.68 
 
 		 5017 aa  61.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  39.5 
 
 		 775 aa  62.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  46.77 
 
 		 1606 aa  62  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  33.86 
 
 		 892 aa  62.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.42 
 
 		 2121 aa  61.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  37.86 
 
 		 751 aa  61.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.43 
 
 		 1657 aa  61.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  31.18 
 
 		 2980 aa  61.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.57 
 
 		 2421 aa  61.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>