112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3592 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  100 
 
 		 1727 aa  3387    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  39.97 
 
 		 5517 aa  318  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  35.98 
 
 		 2990 aa  304  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  33.99 
 
 		 5544 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  34.1 
 
 		 2604 aa  238  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  35.1 
 
 		 1337 aa  224  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  35.1 
 
 		 1337 aa  224  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  31.6 
 
 		 5203 aa  216  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  33.7 
 
 		 5166 aa  194  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  33.27 
 
 		 1263 aa  167  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.82 
 
 		 2656 aa  147  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  34.22 
 
 		 733 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  31.1 
 
 		 2876 aa  132  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  31.31 
 
 		 3373 aa  131  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  32.09 
 
 		 2890 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  37.26 
 
 		 3324 aa  117  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  31.97 
 
 		 1153 aa  115  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  31.97 
 
 		 1153 aa  115  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  40.51 
 
 		 965 aa  110  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  40.51 
 
 		 965 aa  110  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  27.75 
 
 		 2112 aa  110  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.72 
 
 		 1519 aa  97.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  26.07 
 
 		 733 aa  94.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  32.26 
 
 		 892 aa  92  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  26.69 
 
 		 1531 aa  87.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 436 aa  87.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  30.2 
 
 		 2047 aa  86.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  44.14 
 
 		 1389 aa  85.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  37.76 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  31.44 
 
 		 1243 aa  83.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4592  hypothetical protein  34.12 
 
 		 528 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  39.42 
 
 		 1631 aa  77.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  30.66 
 
 		 666 aa  74.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43495  predicted protein  33.96 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00000588522  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  28.57 
 
 		 8918 aa  72.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  33.94 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  35.08 
 
 		 870 aa  70.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  40.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  32.29 
 
 		 1217 aa  69.3  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2617  hypothetical protein  38.41 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0815207  hitchhiker  0.00770419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  39.83 
 
 		 4231 aa  66.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  39.45 
 
 		 1202 aa  64.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  45.33 
 
 		 4723 aa  64.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43412  predicted protein  28.36 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  34.56 
 
 		 1421 aa  63.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  26.68 
 
 		 1518 aa  62.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1665 aa  62.4  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  40.83 
 
 		 8321 aa  59.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2877  hypothetical protein  31.31 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.848063  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 		 1215 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1109 aa  57.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 		 1215 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43494  predicted protein  28.31 
 
 		 456 aa  57.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0119061  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43513  predicted protein  30.73 
 
 		 450 aa  58.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.868692  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  30.41 
 
 		 1215 aa  57.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  42.17 
 
 		 440 aa  57  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  39.76 
 
 		 436 aa  56.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  27.99 
 
 		 586 aa  56.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  39.76 
 
 		 436 aa  56.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.82 
 
 		 1215 aa  56.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  33.07 
 
 		 2743 aa  55.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43460  predicted protein  30.82 
 
 		 515 aa  55.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  29.82 
 
 		 1215 aa  55.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 914 aa  55.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.09 
 
 		 3391 aa  54.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  35.56 
 
 		 934 aa  53.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 850 aa  53.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  54 
 
 		 1150 aa  53.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.59 
 
 		 2555 aa  52.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  34.45 
 
 		 556 aa  52.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  45.9 
 
 		 917 aa  52.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.55 
 
 		 850 aa  51.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  41.18 
 
 		 1323 aa  51.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  41.98 
 
 		 320 aa  50.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  34.85 
 
 		 826 aa  50.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.71 
 
 		 502 aa  50.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1624  ABC-type sugar transport systems permease components-like protein  38.46 
 
 		 503 aa  49.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  33.62 
 
 		 940 aa  49.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  37.01 
 
 		 2476 aa  49.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  30.99 
 
 		 2074 aa  49.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  32.14 
 
 		 983 aa  49.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.4 
 
 		 3699 aa  49.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  37.4 
 
 		 2503 aa  48.9  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  38.64 
 
 		 916 aa  48.9  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 		 994 aa  48.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  36.22 
 
 		 3544 aa  48.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  37.89 
 
 		 1706 aa  48.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 		 5787 aa  47.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.86 
 
 		 3699 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  50 
 
 		 1168 aa  48.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  31.34 
 
 		 1134 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  31.76 
 
 		 491 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.36 
 
 		 371 aa  48.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.09 
 
 		 2839 aa  47.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  30.97 
 
 		 2522 aa  47  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.03 
 
 		 5899 aa  46.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  40.26 
 
 		 1809 aa  46.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  40 
 
 		 695 aa  46.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  32.23 
 
 		 563 aa  47  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>