132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0177 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 5544 aa  11050    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  36.39 
 
 		 5517 aa  685    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  33.91 
 
 		 2990 aa  433  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  34.06 
 
 		 2604 aa  343  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  38.59 
 
 		 1337 aa  323  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  38.59 
 
 		 1337 aa  323  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  28.87 
 
 		 5203 aa  293  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  28.68 
 
 		 5166 aa  285  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1727 aa  235  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  37.6 
 
 		 1153 aa  180  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  37.6 
 
 		 1153 aa  180  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  31.28 
 
 		 1263 aa  164  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  25.48 
 
 		 8918 aa  162  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  29.34 
 
 		 2890 aa  161  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  32.87 
 
 		 733 aa  160  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  27.76 
 
 		 2876 aa  157  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  27.59 
 
 		 3373 aa  154  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  26.66 
 
 		 2262 aa  153  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36 
 
 		 3324 aa  149  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1665 aa  145  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  27.34 
 
 		 733 aa  144  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  38.31 
 
 		 965 aa  137  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  38.31 
 
 		 965 aa  137  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  25.73 
 
 		 2402 aa  137  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  23.4 
 
 		 1531 aa  107  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  34.47 
 
 		 892 aa  105  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  25.86 
 
 		 6497 aa  104  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  24.59 
 
 		 2656 aa  100  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 1519 aa  100  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1064 aa  99  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  34.66 
 
 		 2047 aa  98.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1804 aa  96.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  34.39 
 
 		 2270 aa  94.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  24.86 
 
 		 2112 aa  94  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  24.29 
 
 		 1463 aa  90.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.93 
 
 		 711 aa  90.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  32.94 
 
 		 1377 aa  88.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  24.48 
 
 		 1243 aa  88.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  29.12 
 
 		 436 aa  88.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  28.19 
 
 		 666 aa  87.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.17 
 
 		 2713 aa  84.7  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  30.48 
 
 		 1266 aa  78.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  23.71 
 
 		 561 aa  77.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.48 
 
 		 1657 aa  71.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.07 
 
 		 991 aa  69.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  23.92 
 
 		 874 aa  68.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  27.06 
 
 		 3542 aa  69.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.3 
 
 		 5298 aa  68.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.3 
 
 		 885 aa  68.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  26.97 
 
 		 586 aa  68.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4301  Fibronectin type III domain protein  28.76 
 
 		 1799 aa  66.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130951  decreased coverage  0.00087761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  35.63 
 
 		 4429 aa  66.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1547 aa  65.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  23.71 
 
 		 2005 aa  65.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.74 
 
 		 1288 aa  64.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.86 
 
 		 502 aa  63.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1287 aa  62  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  36.91 
 
 		 917 aa  61.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  24.46 
 
 		 4044 aa  60.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  37.04 
 
 		 1168 aa  60.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  30.53 
 
 		 749 aa  58.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  43.21 
 
 		 1150 aa  58.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1313 aa  58.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  39.82 
 
 		 3737 aa  58.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.85 
 
 		 890 aa  57.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  23.75 
 
 		 535 aa  57.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  26.34 
 
 		 2278 aa  57.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  38.95 
 
 		 2358 aa  56.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  38.95 
 
 		 2490 aa  56.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  38.95 
 
 		 2358 aa  56.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  38.95 
 
 		 2490 aa  56.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  29.43 
 
 		 759 aa  56.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  36.36 
 
 		 2490 aa  56.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.66 
 
 		 1606 aa  56.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1314 aa  56.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.59 
 
 		 4071 aa  55.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1163 aa  55.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  42.25 
 
 		 940 aa  54.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.41 
 
 		 627 aa  54.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1809 aa  54.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  37.12 
 
 		 2833 aa  54.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.63 
 
 		 2176 aa  54.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  39.56 
 
 		 440 aa  53.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  36.84 
 
 		 2490 aa  53.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  35.48 
 
 		 347 aa  53.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  23.21 
 
 		 534 aa  53.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  32.02 
 
 		 1247 aa  52.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  32.14 
 
 		 983 aa  53.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.58 
 
 		 3191 aa  52.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  37.89 
 
 		 2487 aa  53.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  35.79 
 
 		 2490 aa  52.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  35.79 
 
 		 2490 aa  52.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  31.53 
 
 		 892 aa  52  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  26.95 
 
 		 1626 aa  51.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  34.74 
 
 		 2485 aa  51.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  24.87 
 
 		 989 aa  51.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1193 aa  51.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.62 
 
 		 1620 aa  51.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.31 
 
 		 1222 aa  51.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  45.45 
 
 		 941 aa  51.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>