113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00005 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  63.28 
 
 		 1665 aa  1105    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  32.04 
 
 		 3486 aa  749    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  37.84 
 
 		 3634 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  100 
 
 		 8918 aa  16700    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  38.13 
 
 		 2078 aa  600  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.33 
 
 		 4896 aa  512  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  32.68 
 
 		 1989 aa  503  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  36.63 
 
 		 2912 aa  366  9e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.89 
 
 		 3373 aa  242  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  26.84 
 
 		 5517 aa  235  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  33.84 
 
 		 3920 aa  204  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  32.11 
 
 		 2604 aa  193  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  28.87 
 
 		 5203 aa  181  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.4 
 
 		 2358 aa  180  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2358 aa  178  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  30.55 
 
 		 5166 aa  177  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.52 
 
 		 2490 aa  170  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.19 
 
 		 2490 aa  166  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  26.46 
 
 		 2487 aa  166  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.11 
 
 		 2490 aa  165  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.41 
 
 		 2490 aa  163  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  26.14 
 
 		 5544 aa  163  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  29.43 
 
 		 733 aa  157  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.99 
 
 		 2490 aa  154  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  34.89 
 
 		 2074 aa  154  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.96 
 
 		 2490 aa  148  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.56 
 
 		 2485 aa  148  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  25.11 
 
 		 2489 aa  143  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  24.14 
 
 		 1531 aa  142  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  27.18 
 
 		 5444 aa  139  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2520 aa  128  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.96 
 
 		 2656 aa  127  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  27.52 
 
 		 3911 aa  123  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.54 
 
 		 5017 aa  121  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  27.45 
 
 		 5010 aa  108  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.16 
 
 		 1337 aa  105  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.16 
 
 		 1337 aa  105  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.98 
 
 		 2121 aa  105  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.15 
 
 		 2520 aa  104  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.47 
 
 		 3793 aa  103  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  26.05 
 
 		 2112 aa  97.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1946 aa  96.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  25.92 
 
 		 2047 aa  96.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  27.63 
 
 		 2876 aa  95.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  32.25 
 
 		 1263 aa  93.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  26.1 
 
 		 1857 aa  93.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  25.52 
 
 		 3602 aa  92.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.08 
 
 		 2113 aa  91.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 1755 aa  90.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.61 
 
 		 2625 aa  89.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  33.33 
 
 		 733 aa  87.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  25.94 
 
 		 2990 aa  86.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  46.85 
 
 		 1264 aa  80.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1898 aa  78.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1441 aa  73.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  26.06 
 
 		 2573 aa  73.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  24.71 
 
 		 5010 aa  73.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  26.67 
 
 		 1533 aa  73.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  27.71 
 
 		 5017 aa  72.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.42 
 
 		 5010 aa  72.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.52 
 
 		 2724 aa  71.6  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.27 
 
 		 3927 aa  70.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  28.51 
 
 		 2890 aa  69.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  23.91 
 
 		 5010 aa  69.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  28.53 
 
 		 586 aa  68.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  24.18 
 
 		 4897 aa  68.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  26.51 
 
 		 1243 aa  68.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  26.51 
 
 		 2886 aa  68.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  43.12 
 
 		 2487 aa  67.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  24.81 
 
 		 5017 aa  67  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  24.81 
 
 		 5017 aa  67  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1021 aa  65.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_205  hypothetical protein  33.5 
 
 		 653 aa  63.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1908 aa  63.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  49.43 
 
 		 3191 aa  62.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  23.9 
 
 		 2853 aa  61.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1059 aa  60.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.76 
 
 		 5017 aa  60.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.63 
 
 		 1118 aa  60.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 3230 aa  60.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  26.52 
 
 		 396 aa  59.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1987 aa  59.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  35.03 
 
 		 801 aa  58.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1332 aa  58.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  28.14 
 
 		 440 aa  58.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0401  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1213 aa  58.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.051931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  29.04 
 
 		 1153 aa  57.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  29.04 
 
 		 1153 aa  57.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0714  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1387 aa  56.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  24.54 
 
 		 1015 aa  55.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  29.14 
 
 		 792 aa  55.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  28.32 
 
 		 2434 aa  55.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1097  hypothetical protein  28.79 
 
 		 743 aa  54.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0127876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  28.04 
 
 		 983 aa  55.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  29.69 
 
 		 14609 aa  54.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  32.79 
 
 		 2713 aa  53.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1727 aa  53.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  28.7 
 
 		 2000 aa  54.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  44 
 
 		 1984 aa  53.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.4 
 
 		 447 aa  52.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>