124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2197 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  84.69 
 
 		 5166 aa  8245    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 5203 aa  10160    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  37.58 
 
 		 3373 aa  535  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  34.37 
 
 		 5517 aa  459  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  38.63 
 
 		 2047 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  39.32 
 
 		 1243 aa  344  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.37 
 
 		 5544 aa  332  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  32.34 
 
 		 2990 aa  324  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  36.03 
 
 		 2604 aa  297  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  31.27 
 
 		 2656 aa  238  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  34 
 
 		 1337 aa  235  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  34 
 
 		 1337 aa  235  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  41.31 
 
 		 1263 aa  219  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  28.74 
 
 		 733 aa  217  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  37.03 
 
 		 3714 aa  211  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  30.3 
 
 		 2112 aa  207  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1727 aa  201  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  40.27 
 
 		 733 aa  201  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  30.15 
 
 		 2876 aa  196  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  29.28 
 
 		 8918 aa  191  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  26.67 
 
 		 1531 aa  190  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.73 
 
 		 3508 aa  179  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  37.63 
 
 		 586 aa  164  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  27.57 
 
 		 3394 aa  161  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  31.34 
 
 		 2890 aa  152  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  35.09 
 
 		 666 aa  149  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  34.19 
 
 		 1153 aa  138  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  34.19 
 
 		 1153 aa  138  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.01 
 
 		 3816 aa  135  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  34.53 
 
 		 940 aa  127  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  37.63 
 
 		 965 aa  126  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  37.63 
 
 		 965 aa  126  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.17 
 
 		 3324 aa  121  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1665 aa  120  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  26.02 
 
 		 2853 aa  108  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  31.45 
 
 		 941 aa  108  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  34.12 
 
 		 892 aa  105  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1809 aa  102  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1624 aa  101  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  39.63 
 
 		 436 aa  100  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  33.96 
 
 		 1519 aa  99.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  48.7 
 
 		 1118 aa  98.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  36.13 
 
 		 586 aa  86.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  25.74 
 
 		 2886 aa  84.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  26.07 
 
 		 2573 aa  84.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2930  prophage MuMc02, head decoration protein, putative  41.54 
 
 		 466 aa  83.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100371  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  36 
 
 		 807 aa  78.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  33.19 
 
 		 870 aa  77.4  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1537 aa  75.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  41.46 
 
 		 3634 aa  74.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  21.93 
 
 		 2272 aa  70.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.49 
 
 		 1336 aa  70.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.15 
 
 		 753 aa  69.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 850 aa  65.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1223  hypothetical protein  36.84 
 
 		 263 aa  63.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.241489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  29.17 
 
 		 900 aa  62.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  29.24 
 
 		 382 aa  62.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  49.28 
 
 		 714 aa  61.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  22.38 
 
 		 2136 aa  60.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  37.04 
 
 		 914 aa  59.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  32.7 
 
 		 727 aa  59.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.89 
 
 		 3190 aa  59.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  21.2 
 
 		 2179 aa  58.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 788 aa  58.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2490  hypothetical protein  36.11 
 
 		 745 aa  57.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.25 
 
 		 502 aa  58.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  51.61 
 
 		 917 aa  57.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  38.98 
 
 		 1504 aa  57.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  40.51 
 
 		 440 aa  57.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  23.53 
 
 		 3333 aa  56.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1134 aa  57  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  34.65 
 
 		 892 aa  56.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  27.63 
 
 		 2168 aa  56.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.51 
 
 		 3486 aa  55.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50 
 
 		 371 aa  55.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  41.49 
 
 		 689 aa  55.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  42.15 
 
 		 554 aa  54.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  32.46 
 
 		 130 aa  55.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  25.25 
 
 		 1508 aa  54.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  25.51 
 
 		 1102 aa  53.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  37.07 
 
 		 2113 aa  53.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  37.07 
 
 		 1533 aa  53.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  36.21 
 
 		 2520 aa  53.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0015  hypothetical protein  36.05 
 
 		 531 aa  53.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0181047  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.03 
 
 		 5839 aa  53.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  43.4 
 
 		 1150 aa  53.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  30.29 
 
 		 643 aa  52.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0141  cobaltochelatase  29.82 
 
 		 1800 aa  52.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  23.31 
 
 		 3392 aa  52.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  28.5 
 
 		 2912 aa  52.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  53.19 
 
 		 1168 aa  52  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  23.71 
 
 		 882 aa  51.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  39.09 
 
 		 440 aa  52.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  38.26 
 
 		 2121 aa  51.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  35.34 
 
 		 2520 aa  51.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  38.26 
 
 		 1857 aa  51.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  42.86 
 
 		 940 aa  51.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  36.96 
 
 		 916 aa  51.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  36.72 
 
 		 1946 aa  51.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  43.59 
 
 		 2000 aa  51.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>