86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0570 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 2047 aa  4024    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  44.29 
 
 		 3373 aa  971    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  38.62 
 
 		 5166 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  38.52 
 
 		 5203 aa  389  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  34.81 
 
 		 1243 aa  265  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  42.24 
 
 		 436 aa  254  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  45.21 
 
 		 666 aa  218  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  30.68 
 
 		 2604 aa  187  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 		 5517 aa  166  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  33.01 
 
 		 571 aa  159  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  28.35 
 
 		 2656 aa  156  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.38 
 
 		 5544 aa  145  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  34.97 
 
 		 1263 aa  141  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  28.95 
 
 		 1337 aa  136  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  28.95 
 
 		 1337 aa  136  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  39.11 
 
 		 586 aa  135  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  37.09 
 
 		 1153 aa  117  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  37.09 
 
 		 1153 aa  117  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  38.54 
 
 		 965 aa  107  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  38.54 
 
 		 965 aa  107  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  33.96 
 
 		 733 aa  106  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  25.09 
 
 		 733 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  27.38 
 
 		 8918 aa  95.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.86 
 
 		 1519 aa  92  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1665 aa  90.1  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  49.56 
 
 		 1198 aa  90.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  33.5 
 
 		 892 aa  89.4  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1727 aa  88.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1809 aa  85.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  23.68 
 
 		 1531 aa  84.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.82 
 
 		 3324 aa  82.8  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  28.82 
 
 		 2990 aa  80.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  34.09 
 
 		 870 aa  80.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  27.31 
 
 		 2876 aa  78.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.4 
 
 		 753 aa  76.3  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  46.32 
 
 		 2112 aa  74.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.52 
 
 		 3921 aa  73.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.03 
 
 		 1328 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  42.24 
 
 		 1504 aa  70.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  34.02 
 
 		 2890 aa  68.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  37.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  26.61 
 
 		 1150 aa  62.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  25.19 
 
 		 1202 aa  60.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.7 
 
 		 1112 aa  59.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  50.43 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  47.5 
 
 		 684 aa  58.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 1168 aa  58.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  64.44 
 
 		 459 aa  57.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  44.62 
 
 		 440 aa  57  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  29.61 
 
 		 382 aa  55.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  26.64 
 
 		 727 aa  55.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.51 
 
 		 502 aa  55.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  37.65 
 
 		 914 aa  54.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  45.9 
 
 		 940 aa  53.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  28.33 
 
 		 2176 aa  53.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.09 
 
 		 3190 aa  52.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  39.66 
 
 		 450 aa  52.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  32.17 
 
 		 3634 aa  52.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 		 439 aa  52.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  30.59 
 
 		 265 aa  52.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1537 aa  52  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3941  hypothetical protein  28.94 
 
 		 450 aa  51.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  26.71 
 
 		 900 aa  51.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  23.58 
 
 		 1508 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  29.23 
 
 		 991 aa  51.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  40.54 
 
 		 248 aa  51.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1314 aa  50.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.08 
 
 		 831 aa  50.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  24.89 
 
 		 1804 aa  49.7  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.44 
 
 		 371 aa  49.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  26.42 
 
 		 689 aa  49.7  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  39.71 
 
 		 2397 aa  49.3  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  28.19 
 
 		 4896 aa  49.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.65 
 
 		 1336 aa  48.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  48.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  26.15 
 
 		 745 aa  48.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  37.08 
 
 		 845 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1898 aa  48.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  41.18 
 
 		 917 aa  48.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  27.69 
 
 		 1307 aa  47  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 436 aa  46.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 436 aa  46.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  37.7 
 
 		 916 aa  46.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  40.38 
 
 		 892 aa  46.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  23.74 
 
 		 2136 aa  46.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>