55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0546 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1155    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  34.61 
 
 
3373 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  33.1 
 
 
2047 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  32.76 
 
 
1243 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3941  hypothetical protein  29.93 
 
 
450 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123998  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.49 
 
 
1293 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.99 
 
 
3921 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  30.98 
 
 
1129 aa  98.6  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  36.23 
 
 
3911 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  27.17 
 
 
5298 aa  84.3  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  27.32 
 
 
1108 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 
5010 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  28.3 
 
 
5017 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  28.3 
 
 
5017 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  28.3 
 
 
5017 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  28.3 
 
 
5017 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 
5010 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  28.23 
 
 
5017 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  27.7 
 
 
5010 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.77 
 
 
5010 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  28.14 
 
 
2490 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  27.71 
 
 
2490 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3688  hypothetical protein  26.23 
 
 
351 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  28.14 
 
 
2490 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  27.84 
 
 
2490 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  27.84 
 
 
2358 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  27.84 
 
 
2358 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  25.1 
 
 
3472 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  27.84 
 
 
2490 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  28.06 
 
 
2490 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  28.14 
 
 
2485 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3412  hypothetical protein  25.9 
 
 
351 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3362  hypothetical protein  26.23 
 
 
351 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0713978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3692  conserved repeat domain protein  26.23 
 
 
351 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  25.58 
 
 
2489 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.95 
 
 
3521 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  25.56 
 
 
3471 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.39 
 
 
3409 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.16 
 
 
831 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  26.51 
 
 
2487 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0480  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.23 
 
 
1321 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  22.22 
 
 
612 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  24.93 
 
 
470 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  23.86 
 
 
406 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3413  hypothetical protein  26.73 
 
 
359 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3668  hypothetical protein  26.27 
 
 
356 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3693  hypothetical protein  26.73 
 
 
356 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3720  hypothetical protein  26.73 
 
 
359 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  24.39 
 
 
2025 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3449  hypothetical protein  26.73 
 
 
359 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3689  hypothetical protein  27.65 
 
 
359 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3363  hypothetical protein  26.27 
 
 
359 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.749337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  27.66 
 
 
2395 aa  47.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  26.09 
 
 
676 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  28.7 
 
 
1202 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>