47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0658 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  100 
 
 
470 aa  964    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  32.28 
 
 
5298 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  28.16 
 
 
1129 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.3 
 
 
3921 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  26.57 
 
 
1293 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  26.85 
 
 
2487 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  27.43 
 
 
2490 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  27.43 
 
 
2485 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  25.42 
 
 
1108 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  27.43 
 
 
2490 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.17 
 
 
2490 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  29.26 
 
 
2490 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.84 
 
 
2490 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  28.33 
 
 
2358 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  25.84 
 
 
2490 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  28.33 
 
 
2358 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  27.78 
 
 
2489 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3363  hypothetical protein  26.53 
 
 
359 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.749337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0395  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.14 
 
 
801 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3413  hypothetical protein  26.53 
 
 
359 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  24.63 
 
 
1243 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3668  hypothetical protein  25.31 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3720  hypothetical protein  26.12 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  29.56 
 
 
3471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3693  hypothetical protein  26.12 
 
 
356 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3449  hypothetical protein  26.12 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  28.44 
 
 
5017 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  28.44 
 
 
5017 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  28 
 
 
2025 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  29.56 
 
 
3521 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  29.35 
 
 
3472 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  28.37 
 
 
5017 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  29.27 
 
 
3409 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  28 
 
 
5017 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  29.07 
 
 
5010 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3689  hypothetical protein  24.7 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  28 
 
 
5017 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  27.89 
 
 
3373 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  28.63 
 
 
5010 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4612  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.05 
 
 
943 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0211251  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  29.07 
 
 
5010 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.63 
 
 
5010 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  24.93 
 
 
571 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3412  hypothetical protein  23.17 
 
 
351 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3688  hypothetical protein  23.42 
 
 
351 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3692  conserved repeat domain protein  23.38 
 
 
351 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3362  hypothetical protein  23.51 
 
 
351 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0713978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>