88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0749 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  100 
 
 
1129 aa  2231    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  47.64 
 
 
900 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  39.94 
 
 
1293 aa  336  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  39.12 
 
 
3921 aa  322  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  38.04 
 
 
643 aa  319  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  31.71 
 
 
5298 aa  164  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  35.81 
 
 
2490 aa  139  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  35.54 
 
 
2485 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  35.26 
 
 
2358 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  35.26 
 
 
2358 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  35.26 
 
 
2490 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  32.78 
 
 
2490 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  35.26 
 
 
2490 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  35.26 
 
 
2490 aa  135  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  34.71 
 
 
2490 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  29.01 
 
 
470 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  29.92 
 
 
2489 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  34.2 
 
 
2487 aa  128  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  35.45 
 
 
406 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  25.35 
 
 
1108 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  24.37 
 
 
3472 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  30.88 
 
 
5017 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  30.88 
 
 
5017 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  30.68 
 
 
5017 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.8 
 
 
3409 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  31.54 
 
 
5010 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  31.29 
 
 
5010 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  24.08 
 
 
3471 aa  118  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.08 
 
 
3521 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  31.12 
 
 
5010 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  25.11 
 
 
2025 aa  115  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  31.75 
 
 
612 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  31.41 
 
 
5017 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  31.41 
 
 
5017 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  29.48 
 
 
5010 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  31.23 
 
 
571 aa  99.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  29.24 
 
 
2412 aa  99  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  39.46 
 
 
1895 aa  94.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3688  hypothetical protein  33.8 
 
 
351 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3412  hypothetical protein  34.36 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  26.51 
 
 
1285 aa  82.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0395  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.47 
 
 
801 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3692  conserved repeat domain protein  34.03 
 
 
351 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3362  hypothetical protein  34.03 
 
 
351 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0713978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 
3373 aa  79.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  29.86 
 
 
676 aa  78.6  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1593  hypothetical protein  25.08 
 
 
1268 aa  78.2  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  26.97 
 
 
775 aa  77  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4612  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.06 
 
 
943 aa  76.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0211251  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.77 
 
 
939 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  26.26 
 
 
975 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3689  hypothetical protein  31.37 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3693  hypothetical protein  30.31 
 
 
356 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.63 
 
 
831 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3449  hypothetical protein  30.31 
 
 
359 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3720  hypothetical protein  30.31 
 
 
359 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3668  hypothetical protein  30.31 
 
 
356 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3413  hypothetical protein  29.92 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3363  hypothetical protein  29.92 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.749337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  27.75 
 
 
1482 aa  67.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5456  hypothetical protein  34.23 
 
 
672 aa  66.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  26.61 
 
 
1230 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0480  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.08 
 
 
1321 aa  60.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0182  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  30.77 
 
 
825 aa  60.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.97 
 
 
1118 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1961  hypothetical protein  26.63 
 
 
1404 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.40483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  26.96 
 
 
897 aa  58.9  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0405  hypothetical protein  26.6 
 
 
977 aa  57  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0110299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  40.79 
 
 
1482 aa  55.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  40 
 
 
1469 aa  55.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  29.8 
 
 
1533 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  29.29 
 
 
2113 aa  54.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  31.45 
 
 
2520 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  31.45 
 
 
2520 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  25.79 
 
 
924 aa  52  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1892  hypothetical protein  33.9 
 
 
577 aa  51.6  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353065  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  30.5 
 
 
429 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  34.88 
 
 
2233 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.34 
 
 
2656 aa  49.7  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  52.38 
 
 
1857 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  52.38 
 
 
2121 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3701  conserved repeat domain protein  29.79 
 
 
194 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  26.48 
 
 
2886 aa  48.5  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2418  hypothetical protein  24.74 
 
 
1019 aa  48.5  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2719  conserved repeat domain protein  31.85 
 
 
435 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  26.47 
 
 
2395 aa  45.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  46.55 
 
 
2853 aa  45.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03680  conserved repeat protein  30.3 
 
 
693 aa  44.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.158433  normal  0.0107502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>