139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0203 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  100 
 
 
5298 aa  10760    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  26.65 
 
 
6497 aa  573  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  24.65 
 
 
4044 aa  300  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.67 
 
 
2402 aa  282  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  26.28 
 
 
1804 aa  240  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  25.54 
 
 
3958 aa  222  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  29.8 
 
 
2262 aa  216  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 
1293 aa  189  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  31.92 
 
 
1129 aa  156  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  32.28 
 
 
470 aa  154  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.31 
 
 
3921 aa  139  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.16 
 
 
2713 aa  135  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  27.08 
 
 
874 aa  133  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  28.67 
 
 
561 aa  133  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  27.88 
 
 
759 aa  130  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.27 
 
 
1064 aa  127  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.86 
 
 
1463 aa  113  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  28.94 
 
 
2490 aa  101  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  28.94 
 
 
2490 aa  100  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  28.47 
 
 
2490 aa  100  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  28.47 
 
 
2490 aa  100  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  28.47 
 
 
2358 aa  100  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  28.37 
 
 
2358 aa  99  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  28.47 
 
 
2485 aa  99  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  28.95 
 
 
2490 aa  99.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  31.07 
 
 
2487 aa  98.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  25.33 
 
 
1108 aa  97.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  28.17 
 
 
2489 aa  97.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  27.82 
 
 
2490 aa  97.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 
5010 aa  91.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  42.34 
 
 
726 aa  90.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  29.45 
 
 
5017 aa  89.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  27.31 
 
 
5010 aa  89.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  27.31 
 
 
5017 aa  89  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  27.31 
 
 
5017 aa  89  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  27.26 
 
 
815 aa  88.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  27.1 
 
 
5017 aa  87.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  27.1 
 
 
5017 aa  87  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  38.39 
 
 
774 aa  85.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  26.64 
 
 
5010 aa  85.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  38.89 
 
 
1097 aa  84.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  25.83 
 
 
890 aa  84.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.31 
 
 
5010 aa  83.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.31 
 
 
1547 aa  82  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  27.17 
 
 
571 aa  80.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  36.13 
 
 
1634 aa  78.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.18 
 
 
3793 aa  79  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.56 
 
 
885 aa  77.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  40.71 
 
 
3227 aa  76.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  24.78 
 
 
5544 aa  76.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  38.68 
 
 
766 aa  75.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  25.59 
 
 
1193 aa  74.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  35.66 
 
 
873 aa  73.9  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.76 
 
 
1162 aa  73.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1593  hypothetical protein  23.25 
 
 
1268 aa  73.6  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  39.08 
 
 
2364 aa  73.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  27.64 
 
 
540 aa  72.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  39.08 
 
 
860 aa  72  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  25.58 
 
 
2025 aa  71.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  27.24 
 
 
535 aa  71.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  34.88 
 
 
1371 aa  70.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  24.73 
 
 
3373 aa  68.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.34 
 
 
532 aa  69.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.73 
 
 
2927 aa  68.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.73 
 
 
1526 aa  68.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  34.29 
 
 
627 aa  67.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  28.15 
 
 
534 aa  67  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.69 
 
 
1259 aa  66.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  28 
 
 
1163 aa  65.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  37.5 
 
 
1389 aa  64.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3688  hypothetical protein  30.27 
 
 
351 aa  64.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  25.94 
 
 
1222 aa  64.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  27.93 
 
 
503 aa  64.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  26.78 
 
 
1483 aa  63.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.73 
 
 
2296 aa  63.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  25.68 
 
 
3472 aa  62.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  25.24 
 
 
3794 aa  62.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  40.74 
 
 
1139 aa  62  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3412  hypothetical protein  29.19 
 
 
351 aa  60.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  25.12 
 
 
3471 aa  59.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  31.91 
 
 
822 aa  60.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3362  hypothetical protein  28.65 
 
 
351 aa  59.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0713978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.56 
 
 
1059 aa  59.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  32.99 
 
 
2421 aa  58.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.99 
 
 
2411 aa  58.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3692  conserved repeat domain protein  29.1 
 
 
351 aa  59.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.14 
 
 
3471 aa  58.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.99 
 
 
2367 aa  58.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 
3521 aa  58.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  32.99 
 
 
2454 aa  58.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  41.18 
 
 
3602 aa  57.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.48 
 
 
1657 aa  56.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  33.05 
 
 
1287 aa  57  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  32.99 
 
 
2807 aa  56.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  29.6 
 
 
3737 aa  57  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  37.14 
 
 
429 aa  56.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  28 
 
 
4896 aa  56.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  33.78 
 
 
1066 aa  56.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  33.33 
 
 
799 aa  55.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  22.96 
 
 
612 aa  56.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>