133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2481 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 3921 aa  7442    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  36.3 
 
 		 1293 aa  461  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.32 
 
 		 3471 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  38.9 
 
 		 1129 aa  316  6.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  26.55 
 
 		 3602 aa  256  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  32.21 
 
 		 2573 aa  253  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  25.45 
 
 		 4896 aa  232  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  31.14 
 
 		 983 aa  202  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.71 
 
 		 5010 aa  184  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  25.65 
 
 		 5017 aa  182  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  25.65 
 
 		 5017 aa  182  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.52 
 
 		 5010 aa  179  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.27 
 
 		 5010 aa  178  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  25.56 
 
 		 5017 aa  178  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  25.56 
 
 		 5017 aa  175  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.63 
 
 		 2490 aa  174  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  25.76 
 
 		 5010 aa  173  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1332 aa  172  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  26.39 
 
 		 5017 aa  172  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  26.2 
 
 		 2489 aa  157  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.15 
 
 		 1989 aa  156  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  30.45 
 
 		 2490 aa  152  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  30.08 
 
 		 2490 aa  151  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  29.88 
 
 		 2358 aa  151  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  29.88 
 
 		 2485 aa  151  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  29.88 
 
 		 2358 aa  151  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  29.88 
 
 		 2490 aa  150  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  30.31 
 
 		 5298 aa  140  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2490 aa  139  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1227 aa  138  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  29.74 
 
 		 3634 aa  137  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1537 aa  137  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  30.18 
 
 		 2490 aa  134  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  30.12 
 
 		 2487 aa  127  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  29.1 
 
 		 744 aa  124  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1202 aa  119  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  23.75 
 
 		 1108 aa  115  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.69 
 
 		 2121 aa  115  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1059 aa  111  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1809 aa  107  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2520 aa  104  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  27.3 
 
 		 470 aa  104  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.01 
 
 		 2520 aa  100  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  32.82 
 
 		 1150 aa  100  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  25.42 
 
 		 3471 aa  98.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  25.23 
 
 		 3521 aa  97.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  24.36 
 
 		 3472 aa  97.1  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  32.03 
 
 		 574 aa  93.2  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.61 
 
 		 3191 aa  92.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0395  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.14 
 
 		 801 aa  92.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  30.32 
 
 		 1168 aa  91.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  30.77 
 
 		 571 aa  88.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  24.2 
 
 		 2113 aa  87.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  24.05 
 
 		 2025 aa  87.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  24.39 
 
 		 3409 aa  84  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  30.33 
 
 		 1118 aa  84  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0480  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.86 
 
 		 1321 aa  83.6  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  23.92 
 
 		 1533 aa  83.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.59 
 
 		 1519 aa  83.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  34.46 
 
 		 587 aa  83.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3412  hypothetical protein  32.53 
 
 		 351 aa  82  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3688  hypothetical protein  32.53 
 
 		 351 aa  81.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3362  hypothetical protein  32.53 
 
 		 351 aa  80.1  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0713978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3692  conserved repeat domain protein  32.53 
 
 		 351 aa  80.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  29.19 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  24.55 
 
 		 1857 aa  79.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  30.58 
 
 		 406 aa  75.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.04 
 
 		 831 aa  72.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  27.52 
 
 		 2047 aa  72.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  34.71 
 
 		 907 aa  72.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  39 
 
 		 2487 aa  72  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.52 
 
 		 3324 aa  72.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  34.65 
 
 		 845 aa  71.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3363  hypothetical protein  33.72 
 
 		 359 aa  70.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.749337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  41.07 
 
 		 826 aa  70.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  29.5 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3689  hypothetical protein  29.86 
 
 		 359 aa  69.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  69.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3693  hypothetical protein  32.94 
 
 		 356 aa  69.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3449  hypothetical protein  32.94 
 
 		 359 aa  68.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3720  hypothetical protein  32.94 
 
 		 359 aa  68.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3668  hypothetical protein  32.94 
 
 		 356 aa  68.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4612  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.09 
 
 		 943 aa  68.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0211251  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.94 
 
 		 2005 aa  68.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  30.83 
 
 		 1066 aa  67.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3413  hypothetical protein  32.35 
 
 		 359 aa  67.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  38.46 
 
 		 726 aa  67  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  28.97 
 
 		 612 aa  67  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  26.11 
 
 		 347 aa  65.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  27.66 
 
 		 272 aa  64.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1441 aa  63.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  24.39 
 
 		 2748 aa  63.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  25 
 
 		 1243 aa  62.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1038 aa  62.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  30.4 
 
 		 807 aa  62.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  26.46 
 
 		 676 aa  61.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  44.94 
 
 		 827 aa  61.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  25.84 
 
 		 975 aa  60.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  24.56 
 
 		 951 aa  60.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  28.9 
 
 		 801 aa  59.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>