33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2969 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1124    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  79.06 
 
 		 744 aa  774    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  30.1 
 
 		 2573 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  41.03 
 
 		 167 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.74 
 
 		 3921 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 983 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  29 
 
 		 1227 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1059 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1809 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  28.47 
 
 		 1293 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1202 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.43 
 
 		 1989 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.14 
 
 		 3471 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1332 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1182 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1537 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  24.32 
 
 		 2748 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.51 
 
 		 1519 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  33.6 
 
 		 587 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.15 
 
 		 4896 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  28.06 
 
 		 3634 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  26.82 
 
 		 3602 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  27.61 
 
 		 284 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  27.62 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  26.69 
 
 		 272 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28 
 
 		 3419 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1999  Proprotein convertase P  30.34 
 
 		 209 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  28.65 
 
 		 2490 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  28.65 
 
 		 2358 aa  44.3  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1093 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  28.65 
 
 		 2358 aa  44.3  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  28.65 
 
 		 2490 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  28.65 
 
 		 2490 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>