34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2970 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  320  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  74.85 
 
 		 744 aa  243  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  39.22 
 
 		 574 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  32.3 
 
 		 983 aa  63.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  33.57 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  42.31 
 
 		 3921 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  35.03 
 
 		 1989 aa  54.3  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  35 
 
 		 545 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  33.77 
 
 		 1519 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1038 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  32.08 
 
 		 2573 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  35.2 
 
 		 726 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 1293 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1227 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1537 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  34.34 
 
 		 1168 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30.67 
 
 		 3634 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  30 
 
 		 587 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  30.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.46 
 
 		 3471 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  33.82 
 
 		 284 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  47.06 
 
 		 801 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  45.83 
 
 		 5010 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  37.12 
 
 		 775 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1809 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.22 
 
 		 826 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 		 1248 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  45.07 
 
 		 5010 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.08 
 
 		 3191 aa  41.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  44.44 
 
 		 5010 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  46.94 
 
 		 5017 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  46.94 
 
 		 5017 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  46.94 
 
 		 5017 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  46.94 
 
 		 5017 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>