124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4022 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  100 
 
 
1989 aa  3811    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  33.23 
 
 
8918 aa  534  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  34.86 
 
 
2078 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  31.32 
 
 
3486 aa  403  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  34.88 
 
 
3634 aa  390  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.29 
 
 
4896 aa  345  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  34.93 
 
 
2912 aa  336  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  35.54 
 
 
2573 aa  259  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  35.19 
 
 
1293 aa  238  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  37.76 
 
 
1150 aa  187  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  36.63 
 
 
1168 aa  179  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.89 
 
 
3921 aa  154  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  28.93 
 
 
3920 aa  151  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.9 
 
 
3471 aa  149  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  30.86 
 
 
983 aa  143  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  28.26 
 
 
3602 aa  137  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  40.32 
 
 
3191 aa  136  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  44.09 
 
 
801 aa  124  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  31.72 
 
 
1118 aa  124  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.69 
 
 
2358 aa  120  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  25.69 
 
 
2358 aa  119  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.19 
 
 
2490 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  25.19 
 
 
2490 aa  112  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.86 
 
 
1332 aa  108  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.25 
 
 
2490 aa  105  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.17 
 
 
2487 aa  104  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  32.7 
 
 
2604 aa  97.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  33.14 
 
 
775 aa  96.7  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  28.49 
 
 
1227 aa  95.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.48 
 
 
2520 aa  94.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.71 
 
 
2520 aa  94  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.17 
 
 
2489 aa  92.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  24.68 
 
 
2485 aa  92.8  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  25.4 
 
 
2113 aa  91.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  34.42 
 
 
1665 aa  90.5  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  35.69 
 
 
845 aa  88.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  29.93 
 
 
1059 aa  86.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.04 
 
 
2490 aa  86.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  25.05 
 
 
2490 aa  85.9  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03150  hypothetical protein  29.6 
 
 
690 aa  85.5  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345616  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.42 
 
 
1537 aa  84  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.75 
 
 
2490 aa  83.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.54 
 
 
3793 aa  82.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  37.59 
 
 
587 aa  81.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  33.8 
 
 
440 aa  80.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.9 
 
 
2121 aa  78.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  39.83 
 
 
826 aa  77.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  25.24 
 
 
1857 aa  74.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  24.25 
 
 
5010 aa  73.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.01 
 
 
5017 aa  73.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  26.12 
 
 
3911 aa  73.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  30.29 
 
 
1015 aa  73.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  38.79 
 
 
726 aa  73.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  30.28 
 
 
347 aa  72  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  46.15 
 
 
827 aa  71.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.73 
 
 
5010 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  24.09 
 
 
1533 aa  71.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  29.78 
 
 
1519 aa  70.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.33 
 
 
978 aa  69.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  40.45 
 
 
1021 aa  69.3  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.93 
 
 
5017 aa  69.3  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  33.16 
 
 
1202 aa  68.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  36.57 
 
 
1441 aa  67.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  28.09 
 
 
621 aa  67.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  30.22 
 
 
1898 aa  65.9  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  25.32 
 
 
5010 aa  65.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  33.64 
 
 
907 aa  65.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 
853 aa  65.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  28.37 
 
 
744 aa  64.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5685  conserved repeat domain protein  41.03 
 
 
471 aa  63.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  36.84 
 
 
612 aa  63.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4227  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  62.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.298131  normal  0.491791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  29.93 
 
 
2748 aa  62.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  29.01 
 
 
4897 aa  61.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  23.96 
 
 
5017 aa  60.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  23.96 
 
 
5017 aa  60.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  28.66 
 
 
1809 aa  60.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.93 
 
 
3324 aa  60.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  30.57 
 
 
284 aa  60.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.72 
 
 
5017 aa  60.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  32.05 
 
 
2487 aa  59.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  32.03 
 
 
924 aa  58.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.84 
 
 
3927 aa  58.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.31 
 
 
2724 aa  58.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  30.43 
 
 
574 aa  58.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  35.38 
 
 
546 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  26.28 
 
 
5010 aa  56.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  30 
 
 
792 aa  56.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  28.99 
 
 
599 aa  55.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.33 
 
 
2005 aa  54.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  24.84 
 
 
951 aa  54.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  31.79 
 
 
2713 aa  53.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  29.94 
 
 
272 aa  53.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  29.53 
 
 
554 aa  53.1  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  37.29 
 
 
1066 aa  53.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  31.53 
 
 
1134 aa  52.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  36.21 
 
 
545 aa  52.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 
315 aa  52.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  37.29 
 
 
644 aa  52.4  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 
1038 aa  51.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>