23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5685 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5685  conserved repeat domain protein  100 
 
 
471 aa  916    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  44 
 
 
1516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  45 
 
 
1293 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  39.33 
 
 
1989 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  38.52 
 
 
2573 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0149  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 
2262 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  36.92 
 
 
1150 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  38.38 
 
 
1168 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2687  conserved repeat domain protein  34.48 
 
 
541 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000153291  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  37.6 
 
 
3911 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  34.34 
 
 
916 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  30 
 
 
2490 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  31.76 
 
 
951 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  29.84 
 
 
2487 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  30 
 
 
2485 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  34.88 
 
 
2713 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  35.59 
 
 
661 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  35.62 
 
 
3602 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  31.19 
 
 
2490 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  35.9 
 
 
301 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  34.4 
 
 
907 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.2 
 
 
5544 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.17 
 
 
3191 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>