More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3952 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.14 
 
 
4978 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  40.42 
 
 
5745 aa  927    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.24 
 
 
4122 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  100 
 
 
3191 aa  6213    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.27 
 
 
3927 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  42.97 
 
 
16322 aa  517  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.25 
 
 
4848 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.22 
 
 
4836 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.41 
 
 
1884 aa  421  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  56.96 
 
 
2487 aa  393  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.26 
 
 
2555 aa  376  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.63 
 
 
9867 aa  376  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.68 
 
 
3474 aa  346  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  37.1 
 
 
1597 aa  320  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.53 
 
 
4220 aa  316  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  36.71 
 
 
1029 aa  313  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 
1268 aa  312  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36.98 
 
 
2816 aa  309  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.21 
 
 
1269 aa  302  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  32.92 
 
 
1269 aa  297  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  33.65 
 
 
2074 aa  291  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.53 
 
 
1706 aa  290  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  48.92 
 
 
2588 aa  287  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.43 
 
 
3699 aa  285  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 
3363 aa  270  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.45 
 
 
2812 aa  253  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.33 
 
 
3816 aa  252  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.06 
 
 
2839 aa  247  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.89 
 
 
2377 aa  246  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.1 
 
 
2114 aa  244  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.75 
 
 
3182 aa  239  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.28 
 
 
3714 aa  236  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.37 
 
 
3699 aa  234  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  31.35 
 
 
1867 aa  219  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.5 
 
 
2767 aa  216  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  30.91 
 
 
1428 aa  199  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 
994 aa  199  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  33.27 
 
 
892 aa  199  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.48 
 
 
4854 aa  197  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.75 
 
 
3544 aa  197  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.39 
 
 
3477 aa  193  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  35.57 
 
 
721 aa  182  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 
5787 aa  181  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.24 
 
 
8321 aa  181  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  30.07 
 
 
1367 aa  179  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.23 
 
 
5020 aa  175  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30.21 
 
 
1363 aa  171  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  42.19 
 
 
1665 aa  169  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  24.25 
 
 
16311 aa  161  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  46.06 
 
 
3602 aa  160  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.38 
 
 
1512 aa  158  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.73 
 
 
850 aa  157  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.89 
 
 
2853 aa  156  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  27.59 
 
 
5094 aa  154  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.61 
 
 
7284 aa  154  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 
1599 aa  153  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  32.91 
 
 
1416 aa  152  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.44 
 
 
2807 aa  147  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.24 
 
 
5442 aa  146  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.27 
 
 
814 aa  145  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.82 
 
 
2153 aa  142  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  28.52 
 
 
2820 aa  138  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.05 
 
 
5839 aa  137  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  40.32 
 
 
1989 aa  137  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.55 
 
 
3396 aa  135  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  25.29 
 
 
2027 aa  135  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.43 
 
 
4285 aa  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  34.4 
 
 
1215 aa  134  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  35.17 
 
 
1215 aa  134  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.14 
 
 
1141 aa  134  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.4 
 
 
1215 aa  134  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  34.91 
 
 
1215 aa  129  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  34.62 
 
 
1215 aa  129  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.13 
 
 
2353 aa  127  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  51 
 
 
2478 aa  126  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  33.16 
 
 
4791 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  26.33 
 
 
3508 aa  124  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  26.12 
 
 
2524 aa  124  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  38.1 
 
 
2768 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  47.06 
 
 
2602 aa  119  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  50 
 
 
2267 aa  119  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  26.6 
 
 
2056 aa  117  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.76 
 
 
6683 aa  116  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  37.76 
 
 
6779 aa  116  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  37.41 
 
 
6662 aa  113  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  26.72 
 
 
2067 aa  113  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.5 
 
 
4231 aa  113  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  26.63 
 
 
1166 aa  112  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.75 
 
 
761 aa  109  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.6 
 
 
3089 aa  107  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  25.37 
 
 
2051 aa  104  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  25.87 
 
 
2039 aa  103  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.6 
 
 
369 aa  103  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  53.57 
 
 
4896 aa  103  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  25.54 
 
 
2040 aa  100  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  30.88 
 
 
1293 aa  99.8  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  26.26 
 
 
2011 aa  99  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.8 
 
 
2476 aa  97.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  36.03 
 
 
974 aa  97.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  28.32 
 
 
2522 aa  96.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>