95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1287 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  39.79 
 
 
2067 aa  1163    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  36.54 
 
 
2084 aa  956    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  33.79 
 
 
2043 aa  731    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  84.5 
 
 
2040 aa  3317    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  34.62 
 
 
2052 aa  796    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  39.08 
 
 
2039 aa  1065    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  58.04 
 
 
2056 aa  2028    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  58.7 
 
 
2051 aa  2068    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  39.03 
 
 
2027 aa  1111    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 
2011 aa  3999    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  36.13 
 
 
2047 aa  851    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  30.82 
 
 
2069 aa  588  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  30.37 
 
 
1994 aa  538  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  36.28 
 
 
1001 aa  460  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  29.5 
 
 
1052 aa  253  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.79 
 
 
9585 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  29.47 
 
 
721 aa  112  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  26.12 
 
 
1367 aa  107  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.31 
 
 
5745 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.26 
 
 
3191 aa  104  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.78 
 
 
4978 aa  101  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  32.07 
 
 
1879 aa  100  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.8 
 
 
1597 aa  100  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  27.24 
 
 
2816 aa  99.4  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.49 
 
 
4848 aa  96.3  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.8 
 
 
1268 aa  90.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.37 
 
 
9867 aa  90.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.91 
 
 
1269 aa  89.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.96 
 
 
4122 aa  89  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  27.34 
 
 
1363 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  37.06 
 
 
3911 aa  85.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.15 
 
 
1269 aa  84.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.27 
 
 
2114 aa  80.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.17 
 
 
1628 aa  79  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  26.51 
 
 
2042 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.32 
 
 
2192 aa  78.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.29 
 
 
3363 aa  75.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.16 
 
 
2153 aa  72.4  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.83 
 
 
3816 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  31.5 
 
 
1199 aa  70.1  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.19 
 
 
3474 aa  68.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.69 
 
 
2503 aa  68.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  32.6 
 
 
864 aa  66.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  32.65 
 
 
448 aa  65.9  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 
994 aa  65.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.92 
 
 
3544 aa  62.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.47 
 
 
3699 aa  62.4  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 
1215 aa  62  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 
1215 aa  61.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.53 
 
 
1215 aa  61.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  23.62 
 
 
2767 aa  60.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.95 
 
 
2476 aa  60.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  28.91 
 
 
2670 aa  60.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  26.75 
 
 
1061 aa  59.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.75 
 
 
3699 aa  58.9  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  28.33 
 
 
865 aa  58.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.41 
 
 
1416 aa  58.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  34.46 
 
 
1067 aa  58.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  25.81 
 
 
1422 aa  57.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.57 
 
 
1215 aa  57.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.57 
 
 
1215 aa  57.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  27.27 
 
 
2170 aa  57.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  32.97 
 
 
1911 aa  56.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.43 
 
 
2839 aa  57  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  25.74 
 
 
3477 aa  56.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.42 
 
 
1512 aa  56.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  25.79 
 
 
2522 aa  55.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.98 
 
 
3089 aa  55.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.89 
 
 
850 aa  55.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.36 
 
 
761 aa  54.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  33.33 
 
 
2715 aa  54.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.74 
 
 
1848 aa  53.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.41 
 
 
892 aa  53.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  32.58 
 
 
722 aa  53.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  33.49 
 
 
743 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  27.38 
 
 
1462 aa  51.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  28.06 
 
 
1502 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  31.65 
 
 
743 aa  50.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  28.76 
 
 
744 aa  49.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.07 
 
 
1550 aa  50.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.64 
 
 
814 aa  50.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  24.07 
 
 
804 aa  49.7  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  33.8 
 
 
744 aa  48.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.18 
 
 
725 aa  48.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  32.52 
 
 
994 aa  48.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  28 
 
 
663 aa  47.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.64 
 
 
3197 aa  47.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  27.43 
 
 
692 aa  47.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.79 
 
 
680 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  31.36 
 
 
800 aa  46.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  25.94 
 
 
2145 aa  46.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.72 
 
 
1887 aa  46.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  25 
 
 
1351 aa  46.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  31.97 
 
 
755 aa  46.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  23.81 
 
 
16322 aa  45.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>