51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2911 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  87.51 
 
 		 865 aa  1467    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 864 aa  1716    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  31.43 
 
 		 744 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  27.23 
 
 		 822 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  30.31 
 
 		 9585 aa  105  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0633  hypothetical protein  29.61 
 
 		 579 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00895594  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  29.56 
 
 		 1052 aa  88.6  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  30.06 
 
 		 2084 aa  87.4  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  32.11 
 
 		 2039 aa  82.4  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.33 
 
 		 1199 aa  80.5  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  31.71 
 
 		 2047 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1879 aa  79.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.07 
 
 		 1628 aa  77.4  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  28.41 
 
 		 2069 aa  71.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4250  hypothetical protein  29.33 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.75 
 
 		 3911 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.58 
 
 		 2042 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1147  Fibronectin type III domain protein  27.59 
 
 		 979 aa  68.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.478266  hitchhiker  0.000177205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  30.48 
 
 		 2067 aa  67.8  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.18 
 
 		 3544 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  31.9 
 
 		 2040 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1148  Fibronectin type III domain protein  28.11 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.950672  decreased coverage  0.0000360258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  27.76 
 
 		 2056 aa  62  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  32.89 
 
 		 2052 aa  62  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 		 1462 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  30.14 
 
 		 2043 aa  60.1  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27.47 
 
 		 1067 aa  59.7  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  31.91 
 
 		 2011 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  28.52 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  31.09 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  28.42 
 
 		 917 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  29.73 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.33 
 
 		 1221 aa  57.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  30.98 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  28.87 
 
 		 2476 aa  53.9  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.32 
 
 		 2503 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  31.13 
 
 		 2027 aa  52.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  27.5 
 
 		 2051 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.99 
 
 		 2192 aa  51.6  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.23 
 
 		 1550 aa  51.2  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3832  parallel beta-helix repeat protein  25.5 
 
 		 870 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  25.19 
 
 		 667 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.19 
 
 		 804 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1994 aa  48.5  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.93 
 
 		 2522 aa  48.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  27.63 
 
 		 481 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  28.62 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  26.49 
 
 		 2286 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 		 3699 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.3 
 
 		 3699 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  36.36 
 
 		 613 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>