84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2198 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  39.15 
 
 
2067 aa  995    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
2047 aa  3979    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  46.45 
 
 
2052 aa  1406    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  36.13 
 
 
2011 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  34.06 
 
 
2084 aa  765    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  42.53 
 
 
2043 aa  1286    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  36.77 
 
 
1994 aa  855    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  37.32 
 
 
2051 aa  874    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  36.1 
 
 
2040 aa  867    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  38.29 
 
 
2027 aa  791    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  38.39 
 
 
2039 aa  885    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  36.06 
 
 
2056 aa  886    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  32.35 
 
 
2069 aa  546  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  36.11 
 
 
1001 aa  420  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  30.72 
 
 
1052 aa  202  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.5 
 
 
9585 aa  120  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.29 
 
 
721 aa  94.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.77 
 
 
1879 aa  85.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  34.03 
 
 
2042 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.25 
 
 
1597 aa  83.6  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  24.45 
 
 
3191 aa  83.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  31.71 
 
 
864 aa  81.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  31.99 
 
 
865 aa  81.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  29.65 
 
 
1268 aa  80.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.89 
 
 
1269 aa  79.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.76 
 
 
1269 aa  77  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  25.14 
 
 
1367 aa  76.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.18 
 
 
2192 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  37.43 
 
 
3911 aa  73.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  27.16 
 
 
2816 aa  72.4  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 
1215 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 
1215 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.35 
 
 
4978 aa  70.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.1 
 
 
1215 aa  69.3  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.73 
 
 
1215 aa  68.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  28.62 
 
 
1199 aa  68.6  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  23.93 
 
 
1363 aa  67.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.73 
 
 
1628 aa  67.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.16 
 
 
1215 aa  67.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 
3816 aa  66.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  30.81 
 
 
1462 aa  65.9  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  30.28 
 
 
744 aa  65.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.4 
 
 
804 aa  65.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  25.9 
 
 
3477 aa  63.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  26.78 
 
 
3544 aa  63.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.25 
 
 
4848 aa  62.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  42.16 
 
 
2476 aa  62.4  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  23.94 
 
 
1061 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.33 
 
 
5745 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.91 
 
 
1848 aa  60.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.45 
 
 
850 aa  58.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.84 
 
 
2503 aa  58.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.45 
 
 
2153 aa  57  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.01 
 
 
3474 aa  57  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  24.3 
 
 
725 aa  56.2  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.06 
 
 
480 aa  56.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  28.85 
 
 
1911 aa  54.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  28.21 
 
 
3089 aa  52.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  28.78 
 
 
428 aa  52.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  32.58 
 
 
448 aa  52  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.67 
 
 
2522 aa  52.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  23.57 
 
 
1422 aa  52.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  45.19 
 
 
3699 aa  52  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  42.98 
 
 
1550 aa  51.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  31.82 
 
 
614 aa  51.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  31.3 
 
 
2353 aa  50.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 
2114 aa  49.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  25.13 
 
 
454 aa  49.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 
3699 aa  49.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30.41 
 
 
1067 aa  47.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  24.02 
 
 
481 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.73 
 
 
814 aa  48.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  25.19 
 
 
8321 aa  47.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  27.98 
 
 
2715 aa  47.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.63 
 
 
6885 aa  47.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  35.05 
 
 
516 aa  47  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.87 
 
 
1363 aa  47  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.21 
 
 
2068 aa  47  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  29.77 
 
 
744 aa  47  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  33.33 
 
 
561 aa  46.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  34.17 
 
 
613 aa  46.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.3 
 
 
1221 aa  45.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.32 
 
 
1416 aa  45.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  34.96 
 
 
822 aa  45.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>