93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  36.06 
 
 
2051 aa  832    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 
2040 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  35.8 
 
 
2056 aa  822    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  37.21 
 
 
2067 aa  791    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  33.9 
 
 
2084 aa  722    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  34.62 
 
 
2011 aa  808    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  47.47 
 
 
2043 aa  1513    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  36.56 
 
 
1994 aa  862    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
2052 aa  4007    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  34.51 
 
 
2039 aa  721    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  34.61 
 
 
2027 aa  689    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  45.96 
 
 
2047 aa  1398    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  31.38 
 
 
2069 aa  539  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  34.86 
 
 
1001 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  32.11 
 
 
1052 aa  201  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.92 
 
 
9585 aa  115  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  32.05 
 
 
1879 aa  102  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.36 
 
 
2192 aa  99.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.98 
 
 
1628 aa  94  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  26.92 
 
 
721 aa  92.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.18 
 
 
2042 aa  90.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.31 
 
 
1597 aa  87  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  29.38 
 
 
1268 aa  81.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  24.93 
 
 
1367 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  41.71 
 
 
3911 aa  77  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  24.05 
 
 
1363 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.33 
 
 
2503 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.67 
 
 
3699 aa  73.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.78 
 
 
1462 aa  70.1  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  31.77 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  47.37 
 
 
2522 aa  68.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  41.67 
 
 
2476 aa  68.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  26.99 
 
 
1269 aa  67.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.82 
 
 
3191 aa  66.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27.41 
 
 
1269 aa  66.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  46.08 
 
 
3699 aa  66.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  29.95 
 
 
1911 aa  66.6  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  40 
 
 
3544 aa  65.9  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.49 
 
 
3089 aa  65.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.95 
 
 
4122 aa  65.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  32.57 
 
 
864 aa  63.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 
761 aa  63.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  35.8 
 
 
938 aa  62.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  35.12 
 
 
744 aa  61.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  26.87 
 
 
2816 aa  62  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.04 
 
 
3816 aa  61.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.85 
 
 
1199 aa  61.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.36 
 
 
5745 aa  60.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  25.92 
 
 
892 aa  57.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  31.61 
 
 
865 aa  57  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  39.66 
 
 
1550 aa  56.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.95 
 
 
8321 aa  57  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.11 
 
 
4978 aa  56.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  28.82 
 
 
771 aa  55.8  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  43.37 
 
 
801 aa  54.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.41 
 
 
1848 aa  53.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.3 
 
 
6885 aa  52.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.2 
 
 
1884 aa  52.8  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.96 
 
 
850 aa  51.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.78 
 
 
994 aa  51.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  26 
 
 
3363 aa  51.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  28.38 
 
 
3477 aa  50.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.22 
 
 
1215 aa  50.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  24.07 
 
 
16322 aa  50.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 
674 aa  50.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.22 
 
 
1215 aa  50.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  26.93 
 
 
1512 aa  50.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  34.73 
 
 
561 aa  49.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  24.02 
 
 
674 aa  49.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  22.76 
 
 
9867 aa  49.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  24.45 
 
 
674 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  31.15 
 
 
1502 aa  48.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  26.7 
 
 
725 aa  47.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  24.45 
 
 
674 aa  48.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  24.45 
 
 
674 aa  48.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  24.45 
 
 
674 aa  48.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  42.39 
 
 
762 aa  48.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 
804 aa  48.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.29 
 
 
2839 aa  48.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  31.35 
 
 
1215 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 
1215 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 
1215 aa  47.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.95 
 
 
2170 aa  47.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.43 
 
 
1887 aa  47.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.38 
 
 
480 aa  47  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  26.67 
 
 
2353 aa  46.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  22.88 
 
 
1422 aa  46.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.61 
 
 
2153 aa  46.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  24.89 
 
 
674 aa  46.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.52 
 
 
3474 aa  46.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  26.97 
 
 
674 aa  46.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  34.12 
 
 
613 aa  46.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.04 
 
 
741 aa  46.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>