132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1040 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
771 aa  1588    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  36.2 
 
 
9585 aa  139  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.67 
 
 
480 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  32.05 
 
 
903 aa  125  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.54 
 
 
1628 aa  99.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  29.32 
 
 
1042 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.35 
 
 
4433 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.59 
 
 
2068 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.57 
 
 
3507 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  27.9 
 
 
779 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  29.3 
 
 
701 aa  77  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  40.43 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  32.35 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  28.71 
 
 
741 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  27.52 
 
 
2170 aa  73.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  30.05 
 
 
1199 aa  71.6  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  25.55 
 
 
836 aa  71.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  26.35 
 
 
2286 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  26.45 
 
 
680 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  33.48 
 
 
1462 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  26.48 
 
 
801 aa  67.4  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  30.47 
 
 
388 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.98 
 
 
1160 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  36.27 
 
 
539 aa  65.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  37.78 
 
 
239 aa  65.1  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  38.89 
 
 
454 aa  65.1  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  40.91 
 
 
152 aa  65.1  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.22 
 
 
6885 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29.89 
 
 
455 aa  64.3  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.7 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.7 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.26 
 
 
455 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  25.08 
 
 
841 aa  62.4  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.82 
 
 
795 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  26.09 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  32.63 
 
 
287 aa  61.2  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  29.74 
 
 
3911 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  24.82 
 
 
667 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  34.83 
 
 
270 aa  59.7  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.22 
 
 
445 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.8 
 
 
455 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  34.03 
 
 
409 aa  58.9  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  36.52 
 
 
340 aa  58.9  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  29.03 
 
 
455 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.09 
 
 
455 aa  58.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.41 
 
 
455 aa  58.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  26.57 
 
 
692 aa  58.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.11 
 
 
2334 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.44 
 
 
455 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.9 
 
 
455 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.84 
 
 
455 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.31 
 
 
2552 aa  57.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  22.78 
 
 
1363 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  22.78 
 
 
1363 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  22.42 
 
 
1380 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  26.94 
 
 
410 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  23.88 
 
 
2052 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  31.43 
 
 
336 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  28.92 
 
 
410 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  38.68 
 
 
997 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  29.24 
 
 
1351 aa  55.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  29.89 
 
 
743 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 
315 aa  55.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 
3333 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.89 
 
 
648 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  25.51 
 
 
804 aa  54.3  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  35.96 
 
 
995 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  30.6 
 
 
207 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.17 
 
 
649 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  26.85 
 
 
1067 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  30.81 
 
 
448 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  26.63 
 
 
458 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30.6 
 
 
264 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  27.14 
 
 
762 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  26.34 
 
 
456 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  26.11 
 
 
465 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  26.86 
 
 
527 aa  51.6  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  26.05 
 
 
1887 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  28.42 
 
 
1735 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  25.55 
 
 
2084 aa  51.2  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  29.78 
 
 
1695 aa  51.2  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  27.46 
 
 
973 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.1 
 
 
444 aa  50.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  21.8 
 
 
825 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  27.17 
 
 
458 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  24.65 
 
 
456 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
174 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  27.98 
 
 
938 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  28.74 
 
 
744 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  33.73 
 
 
85 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  26.57 
 
 
918 aa  49.3  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  31.46 
 
 
150 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  21.94 
 
 
2764 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  34.67 
 
 
109 aa  49.3  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  29.21 
 
 
136 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.81 
 
 
2286 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  26.9 
 
 
1017 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  25.88 
 
 
404 aa  48.5  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  25.56 
 
 
464 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>