More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0477 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  40.96 
 
 		 4214 aa  1244    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 4220 aa  704    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  33.29 
 
 		 6779 aa  807    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.09 
 
 		 6683 aa  765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  64.56 
 
 		 4122 aa  1052    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 16322 aa  30190    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  33.29 
 
 		 6662 aa  806    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  36.05 
 
 		 4791 aa  851    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  32.77 
 
 		 5444 aa  639  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  42.97 
 
 		 3191 aa  515  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.58 
 
 		 5839 aa  430  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  44.44 
 
 		 4689 aa  424  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  40.9 
 
 		 5442 aa  425  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  39.5 
 
 		 2768 aa  417  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 		 4678 aa  384  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  36.85 
 
 		 4978 aa  354  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.36 
 
 		 5745 aa  330  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  41.49 
 
 		 2251 aa  329  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30.17 
 
 		 3562 aa  312  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.79 
 
 		 1269 aa  300  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  31.52 
 
 		 1269 aa  296  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.94 
 
 		 1268 aa  285  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.96 
 
 		 2812 aa  275  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.34 
 
 		 5080 aa  266  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  67.5 
 
 		 7149 aa  260  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  41.13 
 
 		 1597 aa  254  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.01 
 
 		 1884 aa  246  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  45.11 
 
 		 4285 aa  229  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.9 
 
 		 4836 aa  228  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.98 
 
 		 2555 aa  228  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.35 
 
 		 2239 aa  227  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  36.65 
 
 		 3474 aa  207  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  30.56 
 
 		 4848 aa  200  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.26 
 
 		 2767 aa  200  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.49 
 
 		 5787 aa  199  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.82 
 
 		 9867 aa  192  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  33.88 
 
 		 4854 aa  188  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 2074 aa  185  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.74 
 
 		 3363 aa  181  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  41.77 
 
 		 606 aa  181  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.87 
 
 		 2816 aa  160  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  35.53 
 
 		 3477 aa  160  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.06 
 
 		 1706 aa  159  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.35 
 
 		 994 aa  160  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.32 
 
 		 2839 aa  158  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.93 
 
 		 1599 aa  154  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.68 
 
 		 1367 aa  150  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  28.63 
 
 		 2625 aa  148  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  38.63 
 
 		 739 aa  143  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.94 
 
 		 1867 aa  140  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.95 
 
 		 3816 aa  137  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  29.57 
 
 		 2456 aa  138  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.18 
 
 		 1461 aa  135  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  29.37 
 
 		 1363 aa  135  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.83 
 
 		 721 aa  135  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  27.7 
 
 		 2524 aa  134  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.34 
 
 		 850 aa  132  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  58.09 
 
 		 3182 aa  130  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.48 
 
 		 3927 aa  127  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.68 
 
 		 2807 aa  125  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.27 
 
 		 5962 aa  124  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  41.33 
 
 		 6753 aa  124  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 		 5171 aa  124  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.2 
 
 		 9030 aa  125  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  29.17 
 
 		 892 aa  124  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.8 
 
 		 8682 aa  122  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.53 
 
 		 2114 aa  120  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.77 
 
 		 3721 aa  120  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  30.77 
 
 		 3824 aa  119  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  32.79 
 
 		 8321 aa  117  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.69 
 
 		 814 aa  115  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  30.32 
 
 		 3739 aa  115  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.72 
 
 		 3824 aa  114  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  50.86 
 
 		 5218 aa  115  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  44.59 
 
 		 1166 aa  114  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.84 
 
 		 3824 aa  113  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.34 
 
 		 2887 aa  112  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.15 
 
 		 4106 aa  110  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.13 
 
 		 761 aa  108  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  42.28 
 
 		 3259 aa  108  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  43.54 
 
 		 2542 aa  105  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  40.12 
 
 		 2336 aa  102  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.35 
 
 		 2067 aa  101  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1744 aa  101  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  47.76 
 
 		 2704 aa  99  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.08 
 
 		 1553 aa  98.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.34 
 
 		 3396 aa  98.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  43.11 
 
 		 2452 aa  96.3  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.02 
 
 		 3544 aa  94.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  38.83 
 
 		 1699 aa  92.8  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.28 
 
 		 260 aa  89.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.3 
 
 		 3314 aa  89.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.05 
 
 		 4874 aa  88.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.06 
 
 		 3089 aa  87.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.39 
 
 		 2153 aa  88.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  28.01 
 
 		 3333 aa  88.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1109 aa  87.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.61 
 
 		 1066 aa  87.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.52 
 
 		 3325 aa  86.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  42.34 
 
 		 663 aa  85.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>