More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0186 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  78.88 
 
 		 8682 aa  9661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 6753 aa  13110    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  39.49 
 
 		 5218 aa  2254    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.66 
 
 		 5962 aa  2640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  78.44 
 
 		 9030 aa  9608    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  46.29 
 
 		 4678 aa  528  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  38.24 
 
 		 6779 aa  448  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.77 
 
 		 4836 aa  424  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.36 
 
 		 7149 aa  422  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.76 
 
 		 2239 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  36.68 
 
 		 6662 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.68 
 
 		 6683 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.68 
 
 		 5839 aa  405  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.12 
 
 		 4122 aa  355  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.67 
 
 		 5787 aa  315  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.76 
 
 		 4848 aa  290  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.07 
 
 		 2542 aa  247  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  45.93 
 
 		 4285 aa  219  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  41.79 
 
 		 3259 aa  197  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  38.89 
 
 		 5444 aa  177  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 4220 aa  132  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  47.43 
 
 		 2524 aa  129  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  37.83 
 
 		 1699 aa  127  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  45.39 
 
 		 4214 aa  119  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  41.05 
 
 		 16322 aa  119  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  49.29 
 
 		 2768 aa  118  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  39.73 
 
 		 542 aa  117  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  26.57 
 
 		 7919 aa  115  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  26.3 
 
 		 7679 aa  114  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  47.52 
 
 		 5442 aa  112  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  45.51 
 
 		 2887 aa  110  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  37.02 
 
 		 686 aa  110  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.7 
 
 		 2812 aa  110  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  50.33 
 
 		 2251 aa  110  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  34.03 
 
 		 3184 aa  107  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.57 
 
 		 2704 aa  105  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.14 
 
 		 8321 aa  103  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  42.44 
 
 		 2452 aa  100  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  44.93 
 
 		 2743 aa  98.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  42.48 
 
 		 1166 aa  97.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.56 
 
 		 4106 aa  95.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  38.36 
 
 		 4791 aa  95.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 		 2336 aa  92  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  52.22 
 
 		 475 aa  90.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 3229 aa  90.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  51.11 
 
 		 475 aa  89.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.67 
 
 		 1553 aa  88.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  51.49 
 
 		 260 aa  87  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.59 
 
 		 2067 aa  86.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.58 
 
 		 2346 aa  85.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.14 
 
 		 517 aa  84.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  37.66 
 
 		 5769 aa  83.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.75 
 
 		 219 aa  82.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.11 
 
 		 3314 aa  82.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 1598 aa  82.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  44.03 
 
 		 1883 aa  82  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.51 
 
 		 1164 aa  82  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 820 aa  81.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48 
 
 		 485 aa  81.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  56.63 
 
 		 313 aa  81.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  53.09 
 
 		 2105 aa  80.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  56.63 
 
 		 313 aa  80.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  52.63 
 
 		 1055 aa  81.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  42.06 
 
 		 202 aa  80.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.06 
 
 		 202 aa  80.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  53.85 
 
 		 1499 aa  80.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  51.65 
 
 		 3619 aa  80.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  50.55 
 
 		 3619 aa  80.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  67.19 
 
 		 523 aa  80.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  41.29 
 
 		 4798 aa  80.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.09 
 
 		 1795 aa  80.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  38.1 
 
 		 3182 aa  80.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  42.15 
 
 		 678 aa  80.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  49.54 
 
 		 219 aa  79.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.91 
 
 		 2667 aa  79.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  45.87 
 
 		 1538 aa  79.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.88 
 
 		 1236 aa  79  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.69 
 
 		 9867 aa  79  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.51 
 
 		 4854 aa  78.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  51.76 
 
 		 1037 aa  78.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.26 
 
 		 1534 aa  78.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  44.03 
 
 		 1895 aa  78.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  45.3 
 
 		 510 aa  78.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  49.45 
 
 		 3608 aa  78.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  46.55 
 
 		 1017 aa  78.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  45.74 
 
 		 1022 aa  78.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  53.85 
 
 		 1156 aa  77.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  58.46 
 
 		 534 aa  77.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  51.09 
 
 		 1202 aa  77.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  53.75 
 
 		 3598 aa  77  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.79 
 
 		 588 aa  76.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 2885 aa  75.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  31.17 
 
 		 373 aa  75.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.54 
 
 		 1712 aa  75.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1111 aa  75.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.17 
 
 		 2678 aa  75.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  39.58 
 
 		 486 aa  75.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  53.16 
 
 		 421 aa  75.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  48.86 
 
 		 786 aa  75.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35.8 
 
 		 686 aa  75.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>