194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4113 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  44.66 
 
 		 4106 aa  1661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  35.11 
 
 		 3824 aa  1045    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.84 
 
 		 3824 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  35.14 
 
 		 3739 aa  1006    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  38.49 
 
 		 2456 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.33 
 
 		 3552 aa  984    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.01 
 
 		 2704 aa  999    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  34.79 
 
 		 3824 aa  1036    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  34.15 
 
 		 3516 aa  828    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  32.62 
 
 		 4430 aa  703    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  38.98 
 
 		 2625 aa  798    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  35.6 
 
 		 3325 aa  1103    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  34.51 
 
 		 3721 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 3562 aa  6866    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  34.26 
 
 		 3204 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  32.66 
 
 		 6662 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.69 
 
 		 6683 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  32.21 
 
 		 6779 aa  577  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  29.47 
 
 		 5561 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  29.5 
 
 		 5561 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  29.31 
 
 		 5561 aa  553  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.34 
 
 		 5559 aa  550  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  29.24 
 
 		 5559 aa  546  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  33.73 
 
 		 4689 aa  537  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  33.59 
 
 		 2911 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  30.42 
 
 		 8064 aa  477  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.08 
 
 		 6310 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.12 
 
 		 2927 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.78 
 
 		 5451 aa  453  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  30.09 
 
 		 3923 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.71 
 
 		 3314 aa  357  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  24.97 
 
 		 5444 aa  340  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.59 
 
 		 16322 aa  313  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  27.81 
 
 		 4874 aa  313  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  28.14 
 
 		 5080 aa  300  5e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.59 
 
 		 7149 aa  269  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.69 
 
 		 4480 aa  267  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.27 
 
 		 2402 aa  245  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.51 
 
 		 5839 aa  244  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 3230 aa  237  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.38 
 
 		 4791 aa  234  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  40.77 
 
 		 1278 aa  228  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.23 
 
 		 1461 aa  219  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.51 
 
 		 3736 aa  214  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.12 
 
 		 3734 aa  191  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  38.52 
 
 		 3477 aa  179  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  24.94 
 
 		 4678 aa  171  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  32.27 
 
 		 3586 aa  171  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  26.44 
 
 		 4214 aa  169  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.08 
 
 		 2552 aa  161  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.94 
 
 		 5442 aa  159  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  29.19 
 
 		 2670 aa  144  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  29.17 
 
 		 6715 aa  139  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.76 
 
 		 5216 aa  139  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  25.63 
 
 		 3925 aa  133  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.97 
 
 		 1219 aa  133  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.7 
 
 		 5171 aa  131  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.22 
 
 		 2839 aa  130  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.67 
 
 		 6678 aa  128  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  28.38 
 
 		 562 aa  125  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.87 
 
 		 1951 aa  122  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  31.31 
 
 		 1141 aa  122  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  24.85 
 
 		 1695 aa  117  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  31.22 
 
 		 1301 aa  112  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  37.33 
 
 		 726 aa  108  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  42.16 
 
 		 635 aa  106  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  33.44 
 
 		 739 aa  105  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.11 
 
 		 1096 aa  105  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  29.47 
 
 		 1529 aa  104  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  37.68 
 
 		 959 aa  99  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.01 
 
 		 1586 aa  99  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.69 
 
 		 5743 aa  97.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  26.1 
 
 		 3737 aa  97.1  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.13 
 
 		 5745 aa  96.3  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  31.24 
 
 		 1152 aa  93.6  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  30.54 
 
 		 1092 aa  93.2  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1634 aa  92.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  30.42 
 
 		 500 aa  92.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  26.52 
 
 		 2715 aa  90.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.77 
 
 		 2768 aa  90.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  35.48 
 
 		 606 aa  89.4  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.5 
 
 		 3927 aa  89  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1061 aa  86.7  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1019 aa  85.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.63 
 
 		 1597 aa  82.4  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  29.15 
 
 		 850 aa  82.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  40 
 
 		 1869 aa  81.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 1867 aa  81.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  31.27 
 
 		 675 aa  80.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.61 
 
 		 898 aa  79.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.03 
 
 		 1332 aa  79  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0418  hypothetical protein  28.35 
 
 		 670 aa  78.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  29.04 
 
 		 1699 aa  77.4  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.81 
 
 		 2812 aa  77  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  34.14 
 
 		 4672 aa  76.3  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  33.33 
 
 		 1787 aa  76.6  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1207 aa  73.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.59 
 
 		 1462 aa  73.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  35.14 
 
 		 714 aa  72.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  26.74 
 
 		 888 aa  72.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>