More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0491 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  28.61 
 
 		 5561 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.53 
 
 		 4106 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  28.44 
 
 		 5561 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.78 
 
 		 5839 aa  1345    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.51 
 
 		 6683 aa  3024    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  28.66 
 
 		 5559 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  39.3 
 
 		 5444 aa  1805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.79 
 
 		 5559 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  49.69 
 
 		 6662 aa  3031    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  49.74 
 
 		 6779 aa  3036    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  33.14 
 
 		 3516 aa  996    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  57.51 
 
 		 5442 aa  1206    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 7149 aa  13500    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  39.86 
 
 		 4791 aa  1357    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.57 
 
 		 5561 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.38 
 
 		 4836 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.49 
 
 		 4430 aa  553  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  70.27 
 
 		 2768 aa  549  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  46.78 
 
 		 5171 aa  533  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  29.91 
 
 		 4689 aa  504  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.35 
 
 		 4122 aa  504  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.79 
 
 		 5787 aa  486  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.19 
 
 		 2239 aa  474  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  39.8 
 
 		 4848 aa  476  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  34.16 
 
 		 6753 aa  445  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.46 
 
 		 4220 aa  442  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  34.43 
 
 		 9030 aa  434  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  33.7 
 
 		 8682 aa  431  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  69.06 
 
 		 4285 aa  418  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  63.74 
 
 		 2812 aa  405  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  30.07 
 
 		 2456 aa  400  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.07 
 
 		 2625 aa  389  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  29.71 
 
 		 3325 aa  381  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.18 
 
 		 5962 aa  367  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.9 
 
 		 3739 aa  367  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  36.69 
 
 		 4678 aa  364  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.4 
 
 		 3721 aa  361  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.6 
 
 		 3824 aa  361  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.46 
 
 		 3824 aa  356  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.39 
 
 		 3824 aa  354  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  30.71 
 
 		 2704 aa  322  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.86 
 
 		 3552 aa  310  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  67.5 
 
 		 16322 aa  259  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  35.91 
 
 		 3259 aa  247  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  27.85 
 
 		 3204 aa  246  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.03 
 
 		 3562 aa  240  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  26.89 
 
 		 4874 aa  228  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  33.51 
 
 		 4214 aa  217  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  40.16 
 
 		 2251 aa  199  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27.7 
 
 		 2911 aa  198  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.76 
 
 		 1461 aa  179  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  45.37 
 
 		 2542 aa  172  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  28.57 
 
 		 2890 aa  169  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.68 
 
 		 5745 aa  162  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.33 
 
 		 8321 aa  160  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.42 
 
 		 2927 aa  160  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  47.73 
 
 		 606 aa  158  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 		 4978 aa  155  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  27.29 
 
 		 3736 aa  152  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.04 
 
 		 3734 aa  152  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.39 
 
 		 1599 aa  142  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  30.46 
 
 		 686 aa  142  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  29.81 
 
 		 3182 aa  141  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.08 
 
 		 3314 aa  131  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.91 
 
 		 1597 aa  125  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  37.98 
 
 		 7284 aa  123  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.52 
 
 		 4480 aa  123  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.82 
 
 		 5080 aa  120  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  56.76 
 
 		 1586 aa  119  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  65.96 
 
 		 6678 aa  110  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  33.42 
 
 		 739 aa  108  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  36.97 
 
 		 2127 aa  107  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 		 2555 aa  106  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1699 aa  105  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  38.91 
 
 		 1867 aa  105  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  28.04 
 
 		 1529 aa  105  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  29.31 
 
 		 2743 aa  102  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  37.55 
 
 		 3184 aa  102  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.52 
 
 		 1706 aa  102  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.42 
 
 		 1884 aa  100  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  42.33 
 
 		 1166 aa  99.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.64 
 
 		 5216 aa  98.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.22 
 
 		 1553 aa  96.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.71 
 
 		 2839 aa  96.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  48.98 
 
 		 542 aa  95.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.45 
 
 		 3229 aa  95.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.62 
 
 		 3927 aa  94.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.33 
 
 		 3191 aa  94.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.36 
 
 		 1340 aa  94  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  29.09 
 
 		 2802 aa  92.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  44.85 
 
 		 2452 aa  91.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.33 
 
 		 889 aa  90.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.1 
 
 		 16311 aa  89.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.87 
 
 		 1113 aa  89.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.61 
 
 		 814 aa  88.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 260 aa  88.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.47 
 
 		 3396 aa  87.8  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  41.55 
 
 		 2524 aa  87.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.49 
 
 		 1222 aa  88.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  41.26 
 
 		 2336 aa  87.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>