223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3686 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 1066 aa  2143    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  70.05 
 
 		 759 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  68.7 
 
 		 677 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  40.05 
 
 		 1744 aa  262  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1752 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.99 
 
 		 428 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.23 
 
 		 456 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  40.53 
 
 		 1781 aa  173  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  39.24 
 
 		 663 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  43.86 
 
 		 1597 aa  147  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.73 
 
 		 463 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.01 
 
 		 4978 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1785 aa  121  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  38.94 
 
 		 721 aa  118  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.18 
 
 		 2816 aa  118  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  35.2 
 
 		 631 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.56 
 
 		 1712 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  38.86 
 
 		 2767 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1051 aa  115  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  33.07 
 
 		 1728 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  42 
 
 		 2377 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  38.46 
 
 		 2337 aa  111  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.44 
 
 		 3816 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1838 aa  108  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1589 aa  106  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1282 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.7 
 
 		 761 aa  105  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.18 
 
 		 3363 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  34.72 
 
 		 2353 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  29.91 
 
 		 824 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  38.57 
 
 		 5745 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  39.41 
 
 		 892 aa  99.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.55 
 
 		 2114 aa  100  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  37.13 
 
 		 1009 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  35.94 
 
 		 8321 aa  99  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1512 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  32.77 
 
 		 1367 aa  96.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  35.37 
 
 		 2555 aa  95.1  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  41.21 
 
 		 1502 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.8 
 
 		 1884 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1627 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  28.68 
 
 		 480 aa  92.8  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1416 aa  93.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.57 
 
 		 994 aa  91.3  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  37.44 
 
 		 814 aa  90.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  35.83 
 
 		 5769 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  36.31 
 
 		 642 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  38.35 
 
 		 4848 aa  89.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  40 
 
 		 1269 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.5 
 
 		 850 aa  88.6  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  51.61 
 
 		 16322 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  32.28 
 
 		 1389 aa  87  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  37.79 
 
 		 1268 aa  85.9  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  32.87 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  31.71 
 
 		 1363 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 3927 aa  85.1  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.53 
 
 		 2839 aa  84.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  38.86 
 
 		 1269 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.16 
 
 		 1867 aa  84.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.74 
 
 		 4122 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.66 
 
 		 3544 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.82 
 
 		 2807 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  36.51 
 
 		 3474 aa  82.4  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  31.79 
 
 		 1911 aa  82  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  26.7 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  35.92 
 
 		 2153 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.71 
 
 		 3191 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  31.66 
 
 		 2522 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1006 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.79 
 
 		 3089 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.17 
 
 		 2503 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  29.91 
 
 		 2135 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 3699 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  34.17 
 
 		 1215 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  34.17 
 
 		 1215 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1538 aa  78.2  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1109 aa  77.4  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  29.59 
 
 		 722 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.3 
 
 		 3699 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.38 
 
 		 2476 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.11 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  46.67 
 
 		 5444 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 1215 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 		 1215 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.82 
 
 		 1215 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.85 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.63 
 
 		 1236 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.48 
 
 		 1706 aa  74.3  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  26.39 
 
 		 502 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  28.22 
 
 		 563 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 982 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.62 
 
 		 2145 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.2 
 
 		 1287 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.14 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.07 
 
 		 3477 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1061 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  36.55 
 
 		 1408 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  36.55 
 
 		 1410 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  36.55 
 
 		 1410 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.75 
 
 		 2507 aa  71.2  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>