More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3694 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2507 aa  4910    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.99 
 
 		 11716 aa  247  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  38.01 
 
 		 1434 aa  239  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  37.27 
 
 		 3927 aa  234  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.19 
 
 		 1884 aa  233  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  36.59 
 
 		 702 aa  226  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  36.99 
 
 		 621 aa  216  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  37 
 
 		 7284 aa  199  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  36.78 
 
 		 640 aa  199  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.34 
 
 		 2377 aa  195  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.16 
 
 		 994 aa  193  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.48 
 
 		 892 aa  189  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.88 
 
 		 1597 aa  186  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  37.47 
 
 		 2074 aa  184  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  34.69 
 
 		 1867 aa  180  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.82 
 
 		 4978 aa  175  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.95 
 
 		 5745 aa  172  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  37.91 
 
 		 2153 aa  166  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  32.3 
 
 		 706 aa  166  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.31 
 
 		 1827 aa  163  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  27.99 
 
 		 1437 aa  162  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  29.71 
 
 		 2064 aa  159  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 		 850 aa  155  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.63 
 
 		 3363 aa  154  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.18 
 
 		 369 aa  147  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  32.59 
 
 		 3699 aa  145  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.9 
 
 		 4220 aa  145  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.39 
 
 		 3474 aa  144  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.2 
 
 		 3699 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.21 
 
 		 3544 aa  141  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  31.61 
 
 		 1346 aa  136  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  32.21 
 
 		 721 aa  135  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.49 
 
 		 2839 aa  134  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  30.65 
 
 		 1268 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.91 
 
 		 4848 aa  132  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.03 
 
 		 761 aa  131  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  34.12 
 
 		 937 aa  129  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  30.37 
 
 		 1269 aa  129  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.28 
 
 		 4798 aa  129  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  31.71 
 
 		 1337 aa  128  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.9 
 
 		 1348 aa  127  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.36 
 
 		 2816 aa  127  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.51 
 
 		 2767 aa  126  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  29.38 
 
 		 1433 aa  126  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1512 aa  126  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.11 
 
 		 1269 aa  125  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  32.45 
 
 		 2476 aa  124  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.52 
 
 		 749 aa  122  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.43 
 
 		 2503 aa  122  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  27.9 
 
 		 811 aa  122  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.54 
 
 		 3089 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.7 
 
 		 3816 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.05 
 
 		 2522 aa  120  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1750 aa  119  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.02 
 
 		 814 aa  116  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  31.22 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  27.87 
 
 		 1631 aa  115  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.53 
 
 		 1779 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  27.31 
 
 		 819 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  33.54 
 
 		 885 aa  111  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.6 
 
 		 752 aa  112  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  28.6 
 
 		 3477 aa  112  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  43.93 
 
 		 715 aa  110  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  27.99 
 
 		 2555 aa  107  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.28 
 
 		 1063 aa  107  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.5 
 
 		 2114 aa  103  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1416 aa  100  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.41 
 
 		 2853 aa  98.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.25 
 
 		 1109 aa  98.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  31.25 
 
 		 2820 aa  98.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.23 
 
 		 1553 aa  96.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  29.24 
 
 		 2636 aa  95.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.49 
 
 		 3191 aa  94.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  30.18 
 
 		 3259 aa  94  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  32.65 
 
 		 1421 aa  93.2  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.54 
 
 		 4231 aa  93.2  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.01 
 
 		 8321 aa  92.8  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  28.14 
 
 		 16311 aa  92.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  30.99 
 
 		 1367 aa  92.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.32 
 
 		 1073 aa  89.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  31.96 
 
 		 5094 aa  89  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.82 
 
 		 2812 aa  89  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  30.2 
 
 		 500 aa  88.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1067 aa  88.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.07 
 
 		 5020 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1056 aa  87.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  27.63 
 
 		 3598 aa  88.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.6 
 
 		 1066 aa  87.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 		 3229 aa  87  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1949 aa  86.7  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.79 
 
 		 6678 aa  86.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  29.47 
 
 		 1428 aa  86.3  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.32 
 
 		 2353 aa  84.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.07 
 
 		 1363 aa  84  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  29.05 
 
 		 4285 aa  82.8  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  27.91 
 
 		 16322 aa  82.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.37 
 
 		 3391 aa  82.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.15 
 
 		 4465 aa  82.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.14 
 
 		 2542 aa  81.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  34.35 
 
 		 2233 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>