125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1985 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 
2064 aa  4127    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  33.06 
 
 
1434 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 
11716 aa  263  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  29.83 
 
 
811 aa  240  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  33.9 
 
 
702 aa  238  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  30.08 
 
 
819 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  33.02 
 
 
621 aa  219  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  32.16 
 
 
640 aa  205  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  32.78 
 
 
1827 aa  160  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.02 
 
 
2507 aa  159  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  35.76 
 
 
706 aa  157  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.66 
 
 
1073 aa  110  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  29.79 
 
 
935 aa  108  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.06 
 
 
1437 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  24.03 
 
 
1433 aa  100  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.36 
 
 
1371 aa  100  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  29.13 
 
 
1346 aa  100  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.51 
 
 
2367 aa  99.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.51 
 
 
2411 aa  99.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  37.93 
 
 
627 aa  99.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  32.99 
 
 
2421 aa  97.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  34.46 
 
 
2772 aa  97.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  32.99 
 
 
2454 aa  96.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  29.32 
 
 
1348 aa  95.9  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  32.99 
 
 
2807 aa  95.9  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  33.03 
 
 
750 aa  95.5  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  26.19 
 
 
503 aa  93.6  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34 
 
 
637 aa  92  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  26.39 
 
 
749 aa  91.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  29.96 
 
 
1059 aa  90.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.71 
 
 
1259 aa  89.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0210  C protein alpha-antigen  28.7 
 
 
730 aa  88.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  28.06 
 
 
1337 aa  89  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  38.25 
 
 
1526 aa  88.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.85 
 
 
799 aa  87.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.41 
 
 
2927 aa  87.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  36.26 
 
 
1162 aa  87.4  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  40.62 
 
 
2267 aa  86.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  31.11 
 
 
1287 aa  86.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  30.85 
 
 
792 aa  85.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  38.5 
 
 
2296 aa  85.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  32.42 
 
 
822 aa  84.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.68 
 
 
752 aa  84.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  39.06 
 
 
2478 aa  84.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  41.96 
 
 
2588 aa  82.8  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  24.77 
 
 
3227 aa  81.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  29.78 
 
 
1389 aa  80.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.97 
 
 
2377 aa  81.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  47.78 
 
 
3602 aa  79  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  36.84 
 
 
794 aa  76.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  41.82 
 
 
1665 aa  75.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.71 
 
 
4896 aa  75.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  26.77 
 
 
885 aa  74.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.48 
 
 
642 aa  74.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  36.72 
 
 
2602 aa  73.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  26.13 
 
 
937 aa  73.6  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  27.84 
 
 
2402 aa  73.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  40.43 
 
 
2022 aa  71.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 
885 aa  71.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  29.02 
 
 
650 aa  70.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  36.61 
 
 
711 aa  69.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.61 
 
 
890 aa  69.3  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.96 
 
 
3927 aa  69.3  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  35.16 
 
 
886 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  36.26 
 
 
2005 aa  67.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  33.87 
 
 
1097 aa  67.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.14 
 
 
2487 aa  67.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  39.81 
 
 
636 aa  67  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  38.3 
 
 
3737 aa  66.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.23 
 
 
1606 aa  66.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.23 
 
 
3191 aa  65.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  38.38 
 
 
662 aa  65.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  40.66 
 
 
1066 aa  65.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  38.04 
 
 
315 aa  65.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  31.18 
 
 
1243 aa  63.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  32.97 
 
 
599 aa  63.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.59 
 
 
1620 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  36.26 
 
 
815 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  26.97 
 
 
808 aa  61.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.12 
 
 
1466 aa  60.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  32.95 
 
 
1483 aa  59.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  25.12 
 
 
1547 aa  58.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  33.7 
 
 
1461 aa  58.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  38.14 
 
 
676 aa  58.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  37.8 
 
 
1139 aa  58.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  29.1 
 
 
774 aa  57  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.84 
 
 
3793 aa  57  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.11 
 
 
3324 aa  56.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.03 
 
 
5745 aa  56.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  31.52 
 
 
4013 aa  56.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  39.77 
 
 
749 aa  55.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.06 
 
 
1602 aa  54.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  27.17 
 
 
3471 aa  54.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  27.97 
 
 
3204 aa  52.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  36.36 
 
 
1193 aa  53.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.07 
 
 
2911 aa  52.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  28.21 
 
 
1184 aa  52  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.14 
 
 
1064 aa  52.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  30.83 
 
 
4071 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  28.57 
 
 
726 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>