125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5608 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  100 
 
 		 808 aa  1661    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1287 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.64 
 
 		 1620 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.21 
 
 		 886 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.97 
 
 		 1602 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.05 
 
 		 1606 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.33 
 
 		 1466 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1488 aa  99.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  28.34 
 
 		 650 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  35.59 
 
 		 642 aa  97.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.25 
 
 		 890 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  33.67 
 
 		 885 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  23.42 
 
 		 627 aa  94.4  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 1371 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  26.5 
 
 		 749 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.6 
 
 		 532 aa  87.4  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  27.74 
 
 		 1152 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  25.71 
 
 		 1162 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.31 
 
 		 2367 aa  84.7  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  30.31 
 
 		 2411 aa  84.3  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  25.44 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  27.34 
 
 		 652 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  24.09 
 
 		 794 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.39 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.92 
 
 		 2807 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.92 
 
 		 2421 aa  81.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.92 
 
 		 2454 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1313 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.01 
 
 		 662 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.48 
 
 		 1389 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.2 
 
 		 1222 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.33 
 
 		 3227 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  28.28 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  27.39 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.41 
 
 		 4071 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  32.52 
 
 		 535 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  25.71 
 
 		 1140 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1245 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  26.73 
 
 		 792 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1147 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  27.84 
 
 		 2772 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  26.12 
 
 		 750 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  25.98 
 
 		 1230 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  39.77 
 
 		 2833 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  26.57 
 
 		 2980 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  36.36 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 2972 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  35.92 
 
 		 6497 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  35.59 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  23.61 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.96 
 
 		 4896 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.52 
 
 		 2927 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  30.58 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1163 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.6 
 
 		 3793 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  27.41 
 
 		 967 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  20.88 
 
 		 938 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1064 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  24.02 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  34.09 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  36.36 
 
 		 3542 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.54 
 
 		 822 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  30 
 
 		 1259 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 658 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  26.97 
 
 		 2064 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  39.77 
 
 		 4429 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  37.76 
 
 		 3958 aa  61.6  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  31.97 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  42.53 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1228 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  27.93 
 
 		 3737 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  22.16 
 
 		 3851 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.75 
 
 		 991 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.57 
 
 		 1657 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  34.53 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.3 
 
 		 3927 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1139 aa  54.3  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1547 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  31.11 
 
 		 968 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  32 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1059 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.43 
 
 		 2296 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  38.16 
 
 		 711 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1980 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  34.09 
 
 		 496 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.49 
 
 		 3682 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  32.29 
 
 		 5298 aa  51.2  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  35.35 
 
 		 969 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  22.94 
 
 		 989 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  23.86 
 
 		 2278 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1179  hypothetical protein  27.39 
 
 		 603 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.952655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 1987 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  28.4 
 
 		 1526 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  35.35 
 
 		 963 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.63 
 
 		 565 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  30.69 
 
 		 1097 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  28.83 
 
 		 2588 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  29.01 
 
 		 3324 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  39.36 
 
 		 719 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>