101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0033 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  100 
 
 		 3958 aa  8093    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  30.66 
 
 		 4044 aa  1399    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.64 
 
 		 5298 aa  313  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  25.28 
 
 		 6497 aa  240  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  24.51 
 
 		 2402 aa  190  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  25.5 
 
 		 2262 aa  127  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  43.93 
 
 		 2364 aa  94  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  48.89 
 
 		 860 aa  93.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  30.81 
 
 		 1097 aa  90.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1634 aa  89  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  43.96 
 
 		 766 aa  87.8  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  36.11 
 
 		 726 aa  81.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.33 
 
 		 3227 aa  77.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  37.17 
 
 		 873 aa  77.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1064 aa  76.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  37.61 
 
 		 774 aa  75.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.55 
 
 		 2927 aa  74.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.2 
 
 		 561 aa  74.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.61 
 
 		 4896 aa  74.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  24.04 
 
 		 1463 aa  73.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1804 aa  72.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  38.38 
 
 		 627 aa  72.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  24 
 
 		 759 aa  70.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  37.08 
 
 		 1371 aa  70.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  39.56 
 
 		 1389 aa  69.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.86 
 
 		 815 aa  68.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.45 
 
 		 1526 aa  67  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  33.62 
 
 		 503 aa  67  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  39.51 
 
 		 2421 aa  66.6  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  39.51 
 
 		 2411 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  24.62 
 
 		 652 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  39.51 
 
 		 2367 aa  65.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  39.51 
 
 		 2454 aa  65.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  36.54 
 
 		 1162 aa  65.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1163 aa  65.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.82 
 
 		 2296 aa  65.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1193 aa  65.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  39.74 
 
 		 429 aa  64.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  35.96 
 
 		 822 aa  64.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  40.51 
 
 		 2807 aa  63.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1259 aa  62.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1287 aa  62.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  25.64 
 
 		 540 aa  62.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1059 aa  62  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  23.59 
 
 		 534 aa  61.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  37.76 
 
 		 808 aa  61.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  42.31 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  37.08 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  37.5 
 
 		 2772 aa  59.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.83 
 
 		 3793 aa  59.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  31.9 
 
 		 886 aa  59.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  27.87 
 
 		 535 aa  58.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  31.33 
 
 		 890 aa  58.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1066 aa  57.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  35.56 
 
 		 4429 aa  57.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  28.73 
 
 		 532 aa  57.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  31.71 
 
 		 694 aa  57  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1243 aa  57  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.87 
 
 		 1987 aa  57  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  26.62 
 
 		 3737 aa  56.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  32.76 
 
 		 650 aa  56.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  29.73 
 
 		 3471 aa  55.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.11 
 
 		 1620 aa  54.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.93 
 
 		 3927 aa  54.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  32.99 
 
 		 642 aa  54.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  31.76 
 
 		 799 aa  54.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  29.31 
 
 		 967 aa  53.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  28.46 
 
 		 1222 aa  53.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  42.03 
 
 		 496 aa  53.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  43.04 
 
 		 1313 aa  53.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1547 aa  53.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  35.96 
 
 		 3542 aa  53.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  31.67 
 
 		 1140 aa  52  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  31.33 
 
 		 874 aa  52  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  30.34 
 
 		 2980 aa  52.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  22.2 
 
 		 1483 aa  52.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  38.55 
 
 		 969 aa  52  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.83 
 
 		 1602 aa  51.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 		 5544 aa  51.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  38.55 
 
 		 963 aa  51.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  32.65 
 
 		 676 aa  51.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  33.33 
 
 		 1466 aa  51.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  34.44 
 
 		 2833 aa  50.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  37.5 
 
 		 751 aa  50.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  32.43 
 
 		 4071 aa  50.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  31.73 
 
 		 711 aa  50.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1139 aa  50.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1488 aa  50.1  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.03 
 
 		 2377 aa  49.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  35.11 
 
 		 794 aa  49.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  34.29 
 
 		 636 aa  48.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.91 
 
 		 637 aa  48.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  36.49 
 
 		 2972 aa  49.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  31.43 
 
 		 541 aa  48.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1228 aa  49.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  36 
 
 		 2005 aa  49.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  28.85 
 
 		 2270 aa  48.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.8 
 
 		 1679 aa  47.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.91 
 
 		 1607 aa  47.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.88 
 
 		 1266 aa  47  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>