More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1530 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1162 aa  2394    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.03 
 
 		 1371 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.15 
 
 		 1389 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  26.42 
 
 		 2972 aa  184  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  35.18 
 
 		 822 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  35.83 
 
 		 713 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.13 
 
 		 627 aa  138  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  34.91 
 
 		 675 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  32.53 
 
 		 799 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.06 
 
 		 679 aa  133  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.79 
 
 		 685 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  30.54 
 
 		 859 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  32.63 
 
 		 794 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  35.18 
 
 		 669 aa  129  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.53 
 
 		 1094 aa  128  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.96 
 
 		 1667 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.51 
 
 		 3295 aa  126  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.45 
 
 		 1300 aa  125  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  33.89 
 
 		 561 aa  124  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30 
 
 		 637 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  22.39 
 
 		 886 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.93 
 
 		 910 aa  122  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.03 
 
 		 2036 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.38 
 
 		 1620 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  24.21 
 
 		 2980 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  34.87 
 
 		 1882 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.32 
 
 		 1842 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  27.09 
 
 		 650 aa  122  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  30.65 
 
 		 792 aa  121  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  31.64 
 
 		 528 aa  121  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  32.73 
 
 		 861 aa  121  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  34.5 
 
 		 752 aa  121  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  33.22 
 
 		 958 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.89 
 
 		 1361 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 2554 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.4 
 
 		 1606 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  34.29 
 
 		 581 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1667 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  23.69 
 
 		 1466 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  31.89 
 
 		 1732 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  33.76 
 
 		 551 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.45 
 
 		 1356 aa  118  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.47 
 
 		 547 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  33.9 
 
 		 1120 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.55 
 
 		 735 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.46 
 
 		 2122 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  34.73 
 
 		 791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1682 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  35.98 
 
 		 443 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  33.48 
 
 		 575 aa  115  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  34.02 
 
 		 615 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.62 
 
 		 658 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.17 
 
 		 1862 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  35.54 
 
 		 869 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.23 
 
 		 2000 aa  112  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.6 
 
 		 930 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  33.75 
 
 		 1241 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  33.74 
 
 		 1236 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.45 
 
 		 823 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  31.8 
 
 		 1969 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.6 
 
 		 978 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.41 
 
 		 963 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.19 
 
 		 2272 aa  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.97 
 
 		 929 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.87 
 
 		 941 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1139 aa  108  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  33.2 
 
 		 1814 aa  107  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  33.48 
 
 		 1095 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  27.66 
 
 		 2176 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1282 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.33 
 
 		 1602 aa  106  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 719 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  26.86 
 
 		 1011 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  32.2 
 
 		 870 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  39.19 
 
 		 561 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 819 aa  102  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.96 
 
 		 3227 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.96 
 
 		 840 aa  101  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  35.23 
 
 		 750 aa  101  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.27 
 
 		 786 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  28.47 
 
 		 530 aa  100  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  32.12 
 
 		 460 aa  100  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  34.2 
 
 		 1387 aa  99.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.9 
 
 		 845 aa  99.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.85 
 
 		 971 aa  99.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  31.93 
 
 		 802 aa  98.2  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.47 
 
 		 777 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.72 
 
 		 838 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1259 aa  95.9  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  26.67 
 
 		 1528 aa  95.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  36.57 
 
 		 1931 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1287 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.6 
 
 		 930 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  29.23 
 
 		 439 aa  93.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  32.29 
 
 		 519 aa  93.2  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 1565 aa  93.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  31.05 
 
 		 2552 aa  93.2  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  35.44 
 
 		 2411 aa  92  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  35.44 
 
 		 2367 aa  92  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  34.81 
 
 		 2807 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>